Uniwersytet Jagielloński Collegium Medicum Zakład bioinformatyki i telemedycyny

Prof. dr hab. Irena Roterman-Konieczna

 


Bibliografia UJ CM






1/356

Roterman Irena , Banach Mateusz , Konieczny Leszek .
Application of the Fuzzy Oil Drop Model Describes Amyloid as a Ribbonlike Micelle.
Entropy (Basel, Online)
2017 : Vol. 19, nr 4 art. no. 167, s. 1-19, il., bibliogr. 59 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 1.821
Adres url: http://www.mdpi.com/1099-4300/19/4/167
2/356

Roterman-Konieczna red. nacz. Irena .
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)

2017
Kwartalnik.
p-ISSN: 1896-530X

RCZ
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
3/356

Konieczny Leszek , Roterman Irena , Spólnik Paweł .
Biologia systemów : strategia działania organizmu żywego.
Wyd. 2, zmienione.
Warszawa : Wydawnictwo Naukowe PWN, 2017.
XIII, [1], 235 s. : il.; 24 cm.
p-ISBN: 978-83-01-19196-2

PO
ORG
4/356

Gadzała M. , Kalinowska B. , Banach M[ateusz] , Konieczny L[eszek] , Roterman I[rena] .
Determining protein similarity by comparing hydrophobic core structure.
Heliyon
2017 : Vol. 3, nr 2 art. no. e00235, s. 1-32, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 4.0.

p-ISSN: 2405-8440

AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2405844016313664
Streszczenie w PubMed: 28217749
5/356

Jagusiak Anna , Piekarska Barbara , Pańczyk Tomasz , Jemioła-Rzemińska Małgorzata , Bielańska Elżbieta , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Rybarska Janina , Roterman Irena , Konieczny Leszek .
Dispersion of single-wall carbon nanotubes with supramolecular Congo red - properties of the complexes and mechanism of the interaction.
Beilstein J. Nanotechnol.
2017 : Vol. 8, s. 636-648, il., bibliogr. 40 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 2.0.
Autor korespondencyjny: Anna Jagusiak.

p-ISSN: 2190-4286

AZ
ORG
AIF
IF: 3.127
Adres url: http://www.beilstein-journals.org/bjnano/articles/8/68
Streszczenie w PubMed: 28462065
6/356

Piwowar Monika , Matczyńska Ewa , Malawski Maciej , Szapieniec Tomasz , Roterman-Konieczna Irena .
Genetic traces of never born proteins.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2017 : Vol. 13, nr 2, s. 79-88, il., bibliogr. 30 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Monika Piwowar.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url: https://www.degruyter.com/view/j/bams.2017.13.issue-2/bams-2017-0006/bams-2017-0006.xml?format=INT
7/356

Kalinowska Barbara , Banach Mateusz , Wiśniowski Zdzisław , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Is the hydrophobic core a universal structural element in proteins?
J. Mol. Model.
2017 : Vol. 23, nr 7 art. no. 203, s. 1-16, il., bibliogr. 43 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.

p-ISSN: 1610-2940

AZ
ORG
AIF
IF: 1.425
Adres url: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Is+the+hydrophobic+core+a+universal+structural+element+in+proteins%3F
Streszczenie w PubMed: 28623601
8/356

Rybarska Janina , Konieczny Leszek , Jagusiak Anna , Chłopaś Katarzyna , Zemanek Grzegorz , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Piwowar Piotr , Woźnicka Olga , Roterman Irena .
Silver ions as EM marker of congo red ligation sites in amyloids and amyloid-like aggregates.
Acta Biochim. Pol.
2017 : Vol. 64, nr 1, s. 161-169, il., bibliogr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.

p-ISSN: 0001-527X

AP
ORG
AIF
IF: 1.159
Adres url: http://www.actabp.pl/pdf/1_2017/2016_1393.pdf
Streszczenie w PubMed: 27991937
9/356

Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Wiśniowski Zdzisław , Roterman Irena .
Structure of hydrophobic core in plant carboxylesterase.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2017 : Vol. 13, nr 1, s. 13-16, il., bibliogr. 11 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url: https://www.degruyter.com/view/j/bams.2017.13.issue-1/bams-2017-0001/bams-2017-0001.xml?format=INT
10/356

Banach Mateusz , Wiśniowski Zdzisław , Kalinowska Barbara , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
The variability of protein structure with respect to the hydrophobic core.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2017 : Vol. 13, nr 2, s. 63-68, il., bibliogr. 21 poz., abstr.
Autor korespondencyjny: Irena Roterman.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url: https://www.degruyter.com/view/j/bams.2017.13.issue-2/bams-2017-0004/bams-2017-0004.xml?format=INT
11/356

Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Dissimilar sequence: similar structure of proteins.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2016 : Vol. 12, nr 3, s. 117-121, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
12/356

Roterman-Konieczna Irena .
Impact of the water environment on protein folding.
J. Proteomics Bioinform.
2016 : Vol. 9, nr 10 suppl., s. 68
6th International Conference on Structural Biology August 22-23, 2016 New Orleans, USA.
p-ISSN: 0974-276X

SZZ
AWZ
Adres url: https://www.omicsonline.org/proceedings/impact-of-the-water-environment-on-protein-folding-51202.html
13/356

Łudzik J. , Witkowski A.M. , Roterman-Konieczna I[rena] , Bassoli S. , Farnetani F. , Pellacani G. .
Improving Diagnostic Accuracy of Dermoscopically Equivocal Pink Cutaneous Lesions with Reflectance Confocal Microscopy in Telemedicine Settings: Double Reader Concordance Evaluation of 316 Cases.
PLoS One
2016 : Vol. 11, nr 9 art. no. e0162495, s. 1-11, il., bibliogr. 31 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1932-6203

AZ
ORG
AIF
IF: 2.806
Adres url: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0162495
Streszczenie w PubMed: 27606812
14/356

Roterman Irena , Banach Mateusz , Kalinowska Barbara , Konieczny Leszek .
Influence of the Aqueous Environment on Protein Structure - A Plausible Hypothesis Concerning the Mechanism of Amyloidogenesis.
Entropy (Basel, Online)
2016 : Vol. 18, nr 10 art. no. 351, s. 1-31, il., bibliogr. 86 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 1.821
Adres url: http://www.mdpi.com/1099-4300/18/10/351
15/356

Łudzik Joanna , Witkowski Alexander Michael , Roterman-Konieczna Irena .
New telemedicine techniques in dermatology - evaluation with refl ectance confocal microscopy via cloud-based platform
Folia Med. Crac.
2016 : Vol. 56, nr 3, s. 21-29, il., bibliogr. 27 poz., abstr., sum.
p-ISSN: 0015-5616

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.fmc.cm-uj.krakow.pl/pdf/56_3_21.pdf
16/356

Banach Mateusz , Kalinowska Barbara , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Role of Disulfide Bonds in Stabilizing the Conformation of Selected Enzymes-An Approach Based on Divergence Entropy Applied to the Structure of Hydrophobic Core in Proteins.
Entropy (Basel, Online)
2016 : Vol. 18, nr 3 art. no. 67, s. 1-21, il., bibliogr. 29 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-SA 4.0.
p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 1.821
Adres url: http://www.mdpi.com/1099-4300/18/3/67
17/356

Banach M[ateusz] , Kalinowska B. , Konieczny L[eszek] , Roterman I[rena] .
Sequence-to-Structure Relation in Proteins-Amyloidogenic Proteins with Chameleon Sequences.
J. Proteomics Bioinform.
2016 : Vol. 9, nr 11, s. 264-275, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 0974-276X

AZ
ORG
APZ
Adres url: https://www.omicsonline.org/open-access/sequencetostructure-relation-in-proteinsamyloidogenic-proteins-with-chameleon-sequences-jpb-1000415.php?aid=82022
18/356

Dygut Jacek , Kalinowska Barbara , Banach Mateusz , Piwowar Monika , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Structural Interface Forms and Their Involvement in Stabilization of Multidomain Proteins or Protein Complexes.
Int. J. Mol. Sci.
2016 : Vol. 17, nr 10 art. no. E1741, s. 1-21, il., bibliogr. 59 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC BY 4.0.
p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 3.226
Adres url: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5085769/
Streszczenie w PubMed: 27763556
19/356

Banach M[ateusz] , Kalinowska B. , Konieczny L[eszek] , Roterman I[rena] .
Structural Role of Hydrophobic Core in Proteins-Selected Examples.
J. Proteomics Bioinform.
2016 : Vol. 9, nr 11, s. 276-286, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 0974-276X

AZ
ORG
APZ
Adres url: https://www.omicsonline.org/ArchiveJPB/currentissue-proteomics-bioinformatics-open-access.php
20/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek .
Systems biology - negative-feedback-loop based model to simulate the process in living organisms.
W: Drug Discovery & Therapy World Congress 2016 ; Global Biotechnology Congress 2016, August 22-25 2016, Boston, MA, USA : conference program and list of delegates.
s. 184 : abstr. PO-28.
SZZ
AWZ
21/356

Łudzik Joanna , Witkowski Alexander , Bassoli Sara , Roterman-Konieczna Irena , Pellacani Giovanni .
Zintegrowane użycie dermatoskopii cyfrowej i refleksyjnej mikroskopii konfokalnej oraz telemedycyny w celu poprawy diagnostyki niejednoznacznych różowych zmian skórnych u pacjentów z ryzykiem nowotworów skóry.
Zesz. Nauk. Tow. Doktorantów Uniw. Jagiell., Nauki Ścisłe
2016, nr 1, s. 71.
VI Konferencja Doktorantów Uniwersytetu Jagiellońskiego - Collegium Medicum, Kraków, 23 kwietnia 2016 roku.
p-ISSN: 2082-3827

SZP
AWZ
Adres url: http://www.doktoranci.uj.edu.pl/documents/1167150/a0862a77-158a-44d8-855a-54eec1487beb
22/356

Roterman-Konieczna Irena , Fabian Piotr , Stąpor Katarzyna .
A method of predicting the secondary protein structure based on dictionaries.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 3, s. 163-170, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
DOI: 10.1515/bams-2015-0019
23/356

Rosicka R. , Roterman I[rena] , Banach M[ateusz] .
Analysis of lipid-binding proteins in human brain.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA3
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
24/356

Rosicka Roksana , Banach Mateusz , Roterman-Konieczna Irena .
Application of divergence entropy to characterize the structure of lipid-binding proteins.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 3, s. 171-176, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
DOI: 10.1515/bams-2015-0017
25/356

Kalinowska Barbara , Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Application of divergence entropy to characterize the structure of the hydrophobic core in DNA interacting proteins
Entropy (Basel, Online)
2015 : Vol. 17, nr 3, s. 1477-1507, il., bibliogr. 56 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1099-4300

AZ
ORG
AIF
IF: 1.743
Adres url: http://www.mdpi.com/1099-4300/17/3/1477
DOI: 10.3390/e17031477
26/356

Wach Jakub , Bubak Marian , Konieczny Leszek , Roterman-Konieczna Irena .
Biological Systems Simulations Based on Negative Feedback.
W: CGW Workshop'15, October 26-28, 2015, Krakow, Poland : proceedings.
s. 121-122
SZP
AWZ
27/356

Wiśniowski Z[dzisław] , Roterman I[rena] , Kalinowska B. .
Construction of fuzzy automata for fetermining the structure of the early-stage intermediate in protein folding.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA3
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
28/356

Kalinowska Barbara , Krzykalski Artur , Roterman Irena .
Contingency Table Browser - prediction of early stage protein structure.
Bioinformation
2015 : Vol. 11, nr 10, s. 486-488, il., bibliogr. 10 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4658648/
Streszczenie w PubMed: 26664034
29/356

Banach Mateusz , Prudhomme Nicolas , Carpentier Mathilde , Duprat Elodie , Papandreou Nikolaos , Kalinowska Barbara , Chomilier Jacques , Roterman Irena .
Contribution to the prediction of the fold code: application to immunoglobulin and flavodoxin cases.
PLoS One
2015 : Vol. 10, nr 4 art. no. e0125098, s. 1-26, il., bibliogr. 84 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY 4.0.
p-ISSN: 1932-6203

AZ
ORG
AIF
IF: 3.057
Adres url: http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0125098
Streszczenie w PubMed: 25915049
30/356

Roterman-Konieczna Irena , Banach Mateusz , Konieczny Leszek .
Hydrophobic core structure of macromomycin - the apoprotein of the antitumor antibiotic auromomycin - fuzzy oil drop model applied.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 3, s. 177-181, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
DOI: 10.1515/bams-2015-0014
31/356

Roterman I[rena] , Banach M[ateusz] , Konieczny L[eszek] .
Hydrophobic core structure of macromomycin - the apoprotein of the antitumour antibiotic auromomycin - fuzzy oil drop model applied.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 2, s.eA2-eA3
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
32/356

Roterman-Konieczna Irena .
Information - A tool to interpret the biological phenomena.
W: Simulations in medicine : pre-clinical and clinical applications.
(ed.) Irena Roterman-Konieczna
Berlin : De Gruyter, 2015
s. 57-62
24 cm.
p-ISBN: 978-3-11-040626-9

RMZ
ORG
Adres url: http://www.degruyter.com/view/books/9783110406344/9783110406344-005/9783110406344-005.xml
DOI: 10.1515/9783110406344-005
33/356

Wach J. , Bubak M. , Konieczny L[eszek] , Roterman I[rena] , Chłopaś K. .
Negative feedback based on simulation of bio-systems.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA4
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
34/356

Wach Jakub , Bubak Marian , Konieczny Leszek , Roterman-Konieczna Irena .
Negative feedback based simulation of bio-systems.
W: Eighth ACC Cyfronet AGH Users' Conference : KU KDM 2015, Zakopane, 11-13 Mar 2015 : proceedings.
ed. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak.
Kraków : ACC Cyfronet AGH, 2015.
s. 27-28 : il., bibliogr. 3 poz.
: Zakopane, 2015.03.11
p-ISBN: 978-83-61433-12-5

RZP
ORG
35/356

Wach Jakub , Bubak Marian , Nowakowski Piotr , Roterman Irena , Konieczny Leszek , Chłopaś Katarzyna .
Negative feedback inhibition - Fundamental biological regulation in cells and organisms.
W: Simulations in medicine : pre-clinical and clinical applications.
(ed.) Irena Roterman-Konieczna
Berlin : De Gruyter, 2015
s. 31-56
24 cm.
p-ISBN: 978-3-11-040626-9

RMZ
ORG
RMZ
Adres url: http://www.degruyter.com/view/books/9783110406344/9783110406344-004/9783110406344-004.xml
DOI: 10.1515/9783110406344-004
36/356

Tomanek M. , Roterman I[rena] , Kalinowska B. , Baster Z. , Dulak D. , Szepieniec T. .
Protein folding simulations of '3D Gauss accordant' structures.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA2
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
37/356

Węgrzyn Paweł , Grabska Ewa , Roterman-Konieczna Irena .
Serious games in medicine.
W: Simulations in medicine : pre-clinical and clinical applications.
(ed.) Irena Roterman-Konieczna
Berlin : De Gruyter, 2015
s. 295-328
24 cm.
p-ISBN: 978-3-11-040626-9

RMZ
ORG
RMZ
Adres url: http://www.degruyter.com/view/books/9783110406344/9783110406344-016/9783110406344-016.xml
DOI: 10.1515/9783110406344-016
38/356

Simulations in medicine : pre-clinical and clinical applications.
(ed.) Irena-Roterman-Konieczna
Berlin : De Gruyter, 2015
329 s.; 24 cm.
p-ISBN: 978-3-11-040626-9

MRZ
ORG
MRZ
Adres url: http://www.degruyter.com/viewbooktoc/product/448803
DOI: 10.1515/9783110406344
39/356

Kalinowska Barbara , Fabian Piotr , Stąpor Katarzyna , Roterman Irena .
Statistical dictionaries for hypothetical in silico model of the early-stage intermediate in protein folding.
J. Comput. Aided Mol. Des.
2015 : Vol. 29, nr 7, s. 609-618, il., bibliogr. 33 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 0920-654X

AZ
ORG
AIF
IF: 3.199
Adres url: http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs10822-015-9839-2
Streszczenie w PubMed: 25808133
40/356

Chłopaś K. , Jagusiak A[nna] , Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Roterman I[rena] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Zemanek G[rzegorz] , Bielańska E. , Piwowar P. , Woźnicka O. .
The use of metal-carrying dye markers to reveal the structure of amyloid proteins by EM.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA4
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
41/356

Chłopaś Katarzyna , Jagusiak Anna , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Roterman Irena , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Bielańska Elżbieta , Piwowar Piotr , Sadlik Krystyna .
The use of Titan yellow dye as a metal ion binding marker for studies on the formation of specific complexes by supramolecular Congo red.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 1, s. 9-17, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
42/356

Chomilier J. , Duprat E. , Carpentier M. , Papandreou N. , Banach M[ateusz] , Roterman I[rena] .
What can teach us simulations at the molecular level for the folding of proteins.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2015 : Vol. 11, nr 2, s. eA2
International Conference Cybernetic Modelling of Biological Systems MCSB 2015, Kraków (Poland), 14-15 May 2015.
p-ISSN: 1895-9091

SZM
AWZ
Adres url: https://www.degruyter.com/view/j/bams.2015.11.issue-2/bams-2015-0011/bams-2015-0011.xml?format=INT
43/356

Piwowar Monika , Dygut Jacek , Piwowar Piotr , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Attempt at a systemic outlook on aging and carcinogenesis.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2014 : Vol. 10, nr 3, s. 101-115, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
PRZ
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
44/356

Roterman-Konieczna red. nacz. Irena .
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)

2014
Kwartalnik.
p-ISSN: 1896-530X

RCZ
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
45/356

Tomanek Małgorzata , Szepieniec Tomasz , Roterman-Konieczna Irena .
Flexible Protein Folding Simulator for Cluster Environment.
W: CGW Workshop'14, October 27-29, 2014, Krakow, Poland : proceedings.
s. 109-110
SZP
AWZ
46/356

Piwowar Monika , Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Hydrophobic core formation in protein complex of cathepsin.
J. Biomol. Struct. Dyn.
2014 : Vol. 32, nr 7, s. 1023-1032
p-ISSN: 0739-1102

AZ
ORG
AIF
IF: 2.919
DOI: 10.1080/07391102.2013.801784
47/356

Banach K. , Roterman I[rena] , Prudhomme N. , Chomilier J. .
Hydrophobic core in domains of immunoglobulin-like fold.
J. Biomol. Struct. Dyn.
2014 : Vol. 32, nr 10, s. 1583-1600
p-ISSN: 0739-1102

AZ
ORG
AIF
IF: 2.919
DOI: 10.1080/07391102.2013.829756
48/356

Banach Mateusz , Duprat Elodie , Carpentier Mathilde , Kalinowska Barbara , Roterman Irena , Chomilier Jacques .
Identification of the folding nucleus of globular protein: application to immunoglobulin-like and flavodoxin fold domains.
W: 13th European Conference on Computational Biology : ECCB 2014, Strasbourg, France, 7-10 September, 2014 : program book.
: abstr. E28.
SZZ
AWZ
49/356

Jagusiak A[nna] , Konieczny L[eszek] , Król M[arcin] , Marszałek P. , Piekarska B[arbara] , Piwowar P. , Roterman I[rena] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Zemanek G[rzegorz] .
Intramolecular immunological signal hypothesis revived - structural background of signalling revealed by using Congo red as a specific tool.
Mini Rev. Med. Chem.
2014 : Vol. 14, nr 13, s. 1104-113, il., bibliogr. 63 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC 3.0.
p-ISSN: 1389-5575

AZ
PRZ
AIF
IF: 2.903
Adres url: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4440395/
DOI: 10.2174/1389557514666141127150803
50/356

Kalinowska Barbara , Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Marchewka Damian , Roterman Irena .
Intrinsically disordered proteins-relation to general model expressing the active role of the water environment.
Adv. Protein Chem. Struct. Biol.
2014 : Vol. 94, s. 315-346
p-ISSN: 1876-1623

AZ
ORG
AIF
IF: 3.036
DOI: 10.1016/B978-0-12-800168-4.00008-1
51/356

Dygut Jacek , Płonka Sylwia , Roterman-Konieczna Irena .
Involvement of medical experts in legal proceedings: an e-learning approach.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2014 : Vol. 10, nr 3, s. 159-165, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
52/356

Roterman-Konieczna Irena .
Model symulacji procesu fałdowania łańcucha polipeptydowego.
W: Bioinformatyka.
red. tomu Piotr Pawłowski, Andrzej Polański, Andrzej Świerniak, Piotr Zielenkiewicz
[Warszawa] : Akademicka Oficyna Wydawnicza EXIT, cop. 2014
s. 253-269 : il., bibliogr. 37 poz.
24 cm.
(Inżynieria biomedyczna : podstawy i zastosowania / zespół red. Władysław Torbicz [et al.] ; t. 10)
p-ISBN: 978-83-7837-039-0

RPO
ORG
RMP
53/356

Wach Jakub , Bubak Marian , Konieczny Leszek , Roterman-Konieczna Irena .
Negative Feedback Based Simulation of Bio-systems.
W: CGW Workshop'14, October 27-29, 2014, Krakow, Poland : proceedings.
s. 131-132.
SZP
AWZ
54/356

Roterman Irena , Marchewka Damian .
Personalized Therapy - Challenge for the Medicine in XXI Century.
W: Seventh ACC Cyfronet AGH Users' Conference : KU KDM 2014, Zakopane, 12-14 Mar 2014 : proceedings.
ed. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak.
Kraków : ACC Cyfronet AGH, 2014.
s. 9-10
p-ISBN: 978-83-61433-09-5

SZZ
AWZ
55/356

Tomanek Małgorzata , Roterman Irena , Sterzel Mariusz , Szepieniec Tomasz , Kalinowska Barbara , Baster Zbigniew , Dułak Dawid .
Protein Folding Simulations.
W: Seventh ACC Cyfronet AGH Users' Conference : KU KDM 2014, Zakopane, 12-14 Mar 2014 : proceedings.
ed. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak.
Kraków : ACC Cyfronet AGH, 2014.
s. 59-60
p-ISBN: 978-83-61433-09-5

SZZ
AWZ
56/356

Roterman Irena , Banach Mateusz , Kalinowska Barbara , Konieczny Leszek .
Similar Structure - Different Stabilization - Analysis of Immunoglobulin-Like Domains.
W: 13th European Conference on Computational Biology : ECCB 2014, Strasbourg, France, 7-10 September, 2014 : program book.
SZZ
AWZ
57/356

Roterman Irena , Konieczny L[eszek] , Banach M. , Marchewka D. , Kalinowska B. , Baster Z. , Tomanek M. , Piwowar M[onika] .
Simulation of the protein folding process.
W: Computational methods to study the structure and dynamics of biomolecules and biomolecular processes : from bioinformatics to molecular quantum mechanics.
ed. Adam Liwo
New York : Springer, 2014
s. 599-638
25 cm.
(Springer Series in Bio-/Neuroinformatics ; vol. 1)
p-ISBN: 978-3-642-28553-0

RMZ
ORG
RMZ
DOI: 10.1007/978-3-642-28554-7_18
58/356

Sałapa Kinga , Trawińska Agata , Roterman Irena , Tadeusiewicz Ryszard .
Speaker identification based on artificial neural networks. Case study: the Polish vowel (pilot study).
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2014 : Vol. 10, nr 2, s. 91-99, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1895-9091
e-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
59/356

Konieczny Leszek , Roterman-Konieczna Irena , Spólnik Paweł .
Systems biology : functional strategies of living organisms.
New York : Springer, 2014
XIII, 204 s. : il.; 24 cm. - bibliogr.
p-ISBN: 978-3-319-01335-0

MZ
ORG
MZ
DOI: 10.1007/978-3-319-01336-7
60/356

Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
The fuzzy oil drop model, based on hydrophobicity density distribution, generalizes the influence of water environment on protein structure and function.
J. Theor. Biol.
2014 : Vol. 351, s. 6-17, il., bibliogr., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY-NC-ND 3.0.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.116
Adres url: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519314002781
61/356

Laskowska Ilona , Zając-Lamparska Ludmiła , Wiłkość Monika , Malicki Michał , Szałkowska Agnieszka , Jurgielewicz Anna , Lewandowski Paweł , Węgrzyn Paweł , Roterman-Konieczna Irena , Izdebski Paweł .
A serious game - a new training addressing particularly prospective memory in the elderly.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2013 : Vol. 9, nr 3, s. 155-165, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
DOI: 10.1515/bams-2013-0016
62/356

Wiśniowski Zdzisław , Banach Mateusz , Roterman Irena .
Antifreeze compounds to allow survival at temperatures below 0 C deg.
W: Manufacture Engineering, Quality and Production System II.
ed. Yiyi Zhouzhou
Durnten-Zurich : Trans Tech Publications, 2013
s. 32-38
2nd International Conference on Manufacture Engineering, Quality and Production System (ICMEQP 2013), February 27-28, 2013, Hong Kong, China
: Hong Kong, 2013.02.27
(Advanced Materials Research ; vol. 711)
p-ISBN: 978-3-03785-697-0

RZZ
ORG
DOI: 10.4028/www.scientific.net/AMR.711.32
63/356

Sałapa Kinga , Trawińska Agata , Roterman-Konieczna Irena .
Applying data mining classification techniques to speaker identification.
W: Applications of Mathematics in Biology and Medicine : proceedings of the Nineteenth National Conference, Jastrzębia Góra, 16-20 September 2013
[ed. board Katarzyna D. Lewandowska and Piotr Boguś]
Gdańsk : Department of Physics and Biophysics. Medical University of Gdańsk, 2013
s. 84-89 : il., bibliogr. 13 poz.
: Jastrzębia Góra, 2013.09.16
p-ISBN: 978-83-60253-86-1

RZP
ORG
64/356

Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Roterman-Konieczna Irena .
Can the structure of the hydrophobic core determine the complexation site?
W: Identification of ligand binding site and protein-protein interaction area.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
New York : Springer, 2013
s. 41-54
(Focus on Structural Biology ; Vol. 8)
p-ISBN: 978-94-007-5284-9

RMZ
ORG
RMZ
DOI: 10.1007/978-94-007-5285-6_3
65/356

Alejster Paweł , Banach Mateusz , Jurkowski Wiktor , Marchewka Damian , Roterman-Konieczna Irena .
Comparative analysis of techniques oriented on the recognition of ligand binding area in proteins.
W: Identification of ligand binding site and protein-protein interaction area.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
New York : Springer, 2013
s. 55-86
(Focus on Structural Biology ; Vol. 8)
p-ISBN: 978-94-007-5284-9

RMZ
ORG
RMZ
DOI: 10.1007/978-94-007-5285-6_4
66/356

Salapa K[inga] , Trawinska A[gata] , Roterman I[rena] .
Forensic Speaker Identification Models based on Artificial Neural Networks. Case study: Polish vowel e.
W: 22nd Conference of the International Association for Forensic Phonetics and Acoustics (IAFPA), Tampa, Florida, USA, July 21st-24th, 2013
: il., bibliogr.
SZZ
AWZ
67/356

Sałapa Kinga , Trawińska Agata , Roterman-Konieczna Irena .
Forensic voice comparison by means of artificial neural networks.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2013 : Vol. 9, nr 4, s. 191-197
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
68/356

Kalinowska Barbara , Alejster Paweł , Sałapa Kinga , Baster Zbigniew , Roterman Irena .
Hypothetical in silico model of the early-stage intermediate in protein folding.
J. Mol. Model.
2013 : Vol. 19, nr 10, s. 4259-4269, il., bibliogr., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 1610-2940

AZ
ORG
AIF
IF: 1.867
Adres url: http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00894-013-1909-6
Streszczenie w PubMed: 23812949
69/356

Identification of ligand binding site and protein-protein interaction area.
ed. by Irena Roterman-Konieczna.
New York : Springer, 2013.
167 s.
(Focus on Structural Biology ; Vol. 8)
p-ISBN: 978-94-007-5284-9

MRZ
ORG
MRZ
70/356

Kalinowska Barbara , Alejster Paweł , Sałapa Kinga , Baster Zbigniew , Roterman Irena .
In silico model of the early-stage intermediate in protein folding - analysis of structural predictability.
W: SocBin/BIT13, Torun, Poland, 26-29 June 2013 : book of abstracts
s. 74 : abstr. 22.
SZM
AWZ
71/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Banach Mateusz .
Jak ryby przeżywają stan zamrożenia?
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały XII Sympozjum, Krynica Zdrój, 19-23 maja 2013 : streszczenia referatów
pod red. Janusza Gajdy
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii i Elektroniki AGH, 2013
s. 77-78 : il., bibliogr. 5 poz.
30 cm.
p-ISBN: 978-83-61528-36-4

SZP
AWZ
72/356

Roterman Irena , Tomanek Malgorzata , Sterzel Mariusz , Szepieniec Tomasz , Kalinowska Barbara , Baster Zbigniew , Dułak Dawid .
Managing Protein Folding Process with Intelligent Process Parameters Adjustment.
W: Sixth ACC Cyfronet AGH Users' Conference, Zakopane, 28 February - 1 March 2013 : proceedings
eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak.
Kraków : ACC Cyfronet AGH, cop. 2013
s. 9-11 : il., bibliogr. 14 poz.
24 cm.
: Zakopane, 2013.02.28
p-ISBN: 978-83-61433-07-1

RZM
ORG
73/356

Kononowicz Andrzej A. , Banach Mateusz , Piwowar Monika , Roterman Irena .
Narzędzia stosowane przy zdalnym nauczaniu dyscyplin.
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały XII Sympozjum, Krynica Zdrój, 19-23 maja 2013 : streszczenia referatów
pod red. Janusza Gajdy
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii i Elektroniki AGH, 2013
s. 69-70 : bibliogr. 11 poz.
30 cm.
p-ISBN: 978-83-61528-36-4

SZP
AWZ
74/356

Marchewka Damian , Jurkowski Wiktor , Banach Mateusz , Roterman-Konieczna Irena .
Prediction of protein-protein binding interfaces.
W: Identification of ligand binding site and protein-protein interaction area.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
New York : Springer, 2013
s. 105-134
(Focus on Structural Biology ; Vol. 8)
p-ISBN: 978-94-007-5284-9

RMZ
ORG
RMZ
DOI: 10.1007/978-94-007-5285-6_6
75/356

Konieczny Leszek , Roterman Irena , Piwowar Piotr .
Rytmy cyrkadialne - mechanizm i znaczenie.
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały XII Sympozjum, Krynica Zdrój, 19-23 maja 2013 : streszczenia referatów
pod red. Janusza Gajdy
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii i Elektroniki AGH, 2013
s. 51-52 : il., bibliogr. 12 poz.
30 cm.
p-ISBN: 978-83-61528-36-4

SZP
AWZ
76/356

Tomanek Małgorzata , Roterman Irena , Szepieniec Tomasz , Sterzel Mariusz , Kalinowska Barbara , Baster Zbigniew , Dułak Dawid .
Simulations in bioinformatics.
W: Cracow '13 Grid Workshop, November 4-6, 2013, Krakow, Poland : proceedings.
[eds] Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr.
Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2013
s. 41-42
24 cm.
p-ISBN: 978-83-61433-08-8

SZP
AWZ
77/356

Marchewka D. , Roterman I[rena] .
Sructural analysis of the lactoferrin.
W: SocBin/BIT13, Torun, Poland, 26-29 June 2013 : book of abstracts
s. 94 : abstr. 42.
SZM
AWZ
78/356

Piwowar Monika , Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Structural role of exon-coded fragment of polypeptide chains in selected enzymes.
J. Theor. Biol.
2013 : Vol. 337, s. 15-23, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.303
Adres url: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519313003391
Streszczenie w PubMed: 23896319
79/356

Piwowar Monika , Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Structural role of exon-coded fragments in proteins.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2013 : Vol. 9, nr 3, s. 103-114, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
DOI: 10.1515/bams-2013-0020
80/356

Piwowar Monika , Banach Mateusz , Konieczny Leszek , Chomilier Jacques , Roterman Irena .
Structural role of exons in hemoglobin.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2013 : Vol. 9, nr 2, s. 81-90, il., bibliogr. 21 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.degruyter.com/view/j/bams
DOI: 10.1515/bams-2013-0009
81/356

Roterman Irena .
Sygnał immunologiczny In Silico.
W: III Studencka Konferencja Matematyczno-Informatyczno-Biologiczna "Liczby-Komputery-Życie" : 19 -21 kwietnia 2013, Uniwersytet Jagielloński w Krakowie.
Kraków : AT Wydawnictwo, 2013
s. 8
p-ISBN: 978-83-63910-04-4

SZP
AWZ
82/356

Kononowicz Andrzej A. , Banach Mateusz , Piwowar Monika , Roterman Irena .
The Medical Faculty e-Learning Portfolio.
W: Sixth ACC Cyfronet AGH Users' Conference, Zakopane, 28 February - 1 March 2013 : proceedings
eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak.
Kraków : ACC Cyfronet AGH, cop. 2013
s. 49-51 : bibliogr. 10 poz.
24 cm.
: Zakopane, 2013.02.28
p-ISBN: 978-83-61433-07-1

RZM
ORG
83/356

Roterman-Konieczna Irena , Banach Mateusz .
The role of hydrophobic core in protein complexes.
W: ESF Research Conferences ESF-EMBO Symposium Molecular Perspectives On Protein-Protein Interactions, Pultusk, Poland, 25-30 May 2013
s. 52 : abstr. 44.
SZM
AWZ
84/356

Stopa Barbara , Jagusiak Anna , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Zemanek Grzegorz , Król Marcin , Piwowar Piotr , Roterman Irena .
The use of supramolecular structures as protein ligands.
J. Mol. Model.
2013 : Vol. 19, nr 11, s. 4730-4740, il., bibliogr. 64 poz., abstr.
Open Access Creative Commons Attribution License CC-BY.
p-ISSN: 1610-2940

AZ
ORG
AIF
IF: 1.867
Adres url: http.://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00894-012-1744-1
Streszczenie w PubMed: 23296569
85/356

Kononowicz Andrzej , Roterman Irena .
Virtual patients.
Alma Mater (Krak.)
2013, nr 159, s. 56-59, il.
p-ISSN: 1427-1176

AP
POP
Adres url: http://www.almamater.uj.edu.pl/
86/356

Roterman-Konieczna I[rena] .
A short description of other selected ab initio methods for protein structure prediction.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 165-189
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
87/356

Chmielnicki Wiesław , Roterman-Konieczna Irena , Stąpor Katarzyna .
An improved protein fold recognition with support vector machines.
Expert Syst.
2012 : Vol. 29, nr 2, s. 200-211, il., bibliogr., abstr.
Paper for special issue of Expert Systems 'Statistical, soft and structural methods of pattern recognition' (after CORES 2009 Conference).
p-ISSN: 0266-4720

AZ
ORG
AIF
IF: 0.769
88/356

Spólnik Paweł , Konieczny Leszek , Roterman Irena , Markiewicz Michalł .
Biological clock - is the need for a clock a common issue for cells and computers?
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2012 : Vol. 8, nr 2, s. 255-265, il., bibliogr. 37 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
89/356

Ciepiela Eryk , Jadczyk Tomasz , Harężlak Daniel , Kasztelnik Marek , Nowakowski Piotr , Dyk Grzegorz , Malawski Maciej , Bubak Marian , Roterman Irena .
Computations of protein hydrophobicity profile as virtual experiment in GridSpace virtual laboratory.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2012 : Vol. 8, nr 4, s. 361-372, il., bibliogr. 13 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
90/356

Konieczny L. , Roterman-Konieczna I[rena] .
Conclusion.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 191-202 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
91/356

Jadczyk Tomasz , Malawski Maciej , Bubak Marian , Roterman Irena .
Examining protein folding process simulation and searching for common structure motifs in a protein family as experiments in the GridSpace2 virtual laboratory.
W: Building a national distributed E-infrastructure--PL-grid : scientific and technical achievements.
[edited by] Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr
New York : Springer, 2012
s. 252-264 : bibliogr. 23 poz.
(Lecture Notes in Computer Science ; vol. 7136)
p-ISBN: 978-3-642-28266-9

RMZ
ORG
RMZ
92/356

Banach Mateusz , Prymula Katarzyna , Jurkowski Wiktor , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Fuzzy oil drop model to interpret the structure of antifreeze proteins and their mutants.
J. Mol. Model.
2012 : Vol. 18, nr 1, s. 229-237, il., bibliogr. 25 poz., abstr.
p-ISSN: 0949-183X

AZ
ORG
AIF
IF: 1.984
93/356

Jagusiak A[nna] , Piekarska B[arbara] , Stopa Barbara , Rotterman I[rena] , Konieczny L. , Król M. , Marszałek P[aulina] G. , Zemanek G[rzegorz] .
Intramolecular signaling in antibodies.
Acta Biochim. Pol.
2012 : Vol. 59, suppl. 3, s. 126, abstr. P4.14
47th Congress of the Polish Biochemical Society Polish-German Biochemical Societies Joint Meeting, Poznań, 11th - 14th September 2012 .
p-ISSN: 1734-154X

SZM
SIF
94/356

Roterman-Konieczna Irena .
Introduction.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. xxvii-xxviii : bibliogr. 1 poz.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

000
95/356

Banach M. , Konieczny L. , Roterman-Konieczna I[rena] .
Ligand-binding recognition.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 79-93 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
96/356

Sałapa Kinga , Kalinowska Barbara , Jadczyk Tomasz , Roterman Irena .
Measurement of hydrophobicity distribution in proteins - complete redundant protein data bank.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2012 : Vol. 8, nr 2, s. 196-206, il., bibliogr. 8 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
97/356

Sałapa Kinga , Kalinowska Barbara , Jadczyk Tomasz , Roterman Irena .
Measurement of hydrophobicity distribution in proteins - non-redundant protein data bank.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2012 : Vol. 8, nr 3, s. 327-338, il., bibliogr. 7 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
98/356

Król M. , Konieczny L. , Stąpor K. , Wiśniowski Z[dzisław] , Ziajka W[ojciech] , Szoniec G. , Roterman-Konieczna I[rena] .
Misfolded proteins.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 141-164 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
99/356

Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
240 s. : il.; 21 cm.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

MRZ
ORG
MRZ
100/356

Roterman-Konieczna Irena , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Piwowar Piotr .
Rejestracja i ocena ilościowa niestabilnych białek surowicy krwi.
Pomiary, Autom., Kontr.
2012 : Vol. 58, nr 4, s. 379-382, il., bibliogr. 17 poz., abstr., streszcz.
p-ISSN: 0032-4140

AP
ORG
KBN
101/356

Konieczny L. , Roterman-Konieczna I[rena] .
Simulation of the polypeptide chain folding process using the "fuzzy oil drop" model.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 123-140 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
102/356

Konieczny Leszek , Banach Mateusz , Roterman Irena .
Stability of two natural homologous proteins with different folds.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2012 : Vol. 8, nr 2, s. 185-193, il., bibliogr. 16 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
103/356

Roterman-Konieczna Irena , Kalinowska Barbara , Baster Zbigniew .
Structural form for early stage protein folding process simulation.
W: Modeling & Design of Molecular Materials 2012, Wrocław, Poland, September 10-14, 2012 : conference information & abstracts
: abstr. P77B
SZM
AWZ
104/356

Alejster P. , Jurkowski W. , Roterman-Konieczna I[rena] .
Structural information involved in the interpretation of the stepwise protein folding proces.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 39-54 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
105/356

Konieczny Leszek , Markiewicz Michał , Piwowar Piotr , Roterman Irena .
Technical solutions for bio-measurements.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2012 : Vol. 8, nr 4, s. 339-349
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
106/356

Banach M. , Marchewka D. , Piwowar M[onika] , Roterman-Konieczna I[rena] .
The divergence entropy characterizing the internal force field in proteins.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 55-77 : bibliogr. 31 poz., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
107/356

Jurkowski W[iktor] , Baster Z. , Dułak D. , Roterman-Konieczna I[rena] .
The early-stage intermediate.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 1-20 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
108/356

Banach M. , Konieczny L. , Roterman-Konieczna I[rena] .
The late-stage intermediate.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 21-37 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
109/356

Banach M. , Konieczny L. , Roterman-Konieczna I[rena] .
Use of the "fuzzy oil drop" model to identify the complexation area in protein homodimers.
W: Protein folding in silico : protein folding versus protein structure prediction.
ed. by Irena Roterman-Konieczna
Philadelphia, PA : Woodhead Pub., 2012
s. 95-122 : bibliogr., abstr.
(Woodhead Publishing Series in Biomedicine ; nr 22)
p-ISBN: 978-1-907568-17-6

RMZ
ORG
RMZ
110/356

Banach Mateusz , Prymula Katarzyna , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
"Fuzzy oil drop" model verified positively.
Bioinformation
2011 : Vol. 5, nr 9, s. 375-377, il., bibliogr. 14 poz., abstr.
p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
111/356

Evangelista Giuseppe , Minervini Giovanni , Polticelli Fabio , Malawski Maciej , Szepieniec Tomasz , Flis Lukasz , Prymula Katarzyna , Kochanczyk Marek , Matczynska Ewa , Wisniowski Zdzislaw , Salapa Kinga , Banach Mateusz , Roterman Irena .
Ab initio Protein structure prediction - the hydrophobicity distribution analysis.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2011 : Vol. 7, nr 2, s. 5-12, il., bibliogr. 19 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
112/356

Spólnik Paweł , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Biological Clock - is the Need for a Clock a Common Factor for Cells and Computers?
W: Cracow '11 Grid Workshop, Kraków, Poland, November 7-9, 2011 : abstracts
: A
: bibliogr. 5 poz.
SZP
AWZ
113/356

Prymula Katarzyna , Jadczyk Tomasz , Roterman Irena .
Catalytic residues in hydrolases : analysis of methods designed for ligand-binding site prediction.
J. Comput. Aided Mol. Des.
2011 : Vol. 25, nr 2, s. 117-133, il., bibliogr. 108 poz., abstr.
p-ISSN: 0920-654X

AZ
ORG
AIF
IF: 3.386
114/356

Swatowski Michał , Piwowar Monika , Czudek Bartlomiej , Roterman-Konieczna Irena .
Determination of gene's expression strength influence on function (process) component in comparison to other expressed genes.
W: Human Genome Meeting HGM 2011, Dubai, 14-17 March 2011 : program and abstract book
s. 176-177 : abstr. P71
SZZ
AWZ
115/356

Guzik Piotr , Brongel Leszek , Roterman-Konieczna Irena , Sałapa Kinga , Lorkowski Jacek , Budzyński Piotr , Trybus Marek .
Diagnostic groups of risk in trauma patients as independent groups of patients. Proposition for National Helth Founadtion. Clinical estimation costs of treatment. III. Diagnostic groups of risk.
Ostry Dyżur
2011 : T. 4, nr 1, s. 18-28, il., bibliogr. 20 poz.
p-ISSN: 1898-3316

AP
ORG
KBN
Adres url: http://ostrydyzur.net
116/356

Elementy informatyki medycznej. 1, Ścieżki kliniczne, wirtualny pacjent, telekonsultacje.
Irena Roterman-Konieczna
Kraków : Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2011
202 : [1] s. : il. ; 24 cm., bibliogr. przy rozdz.
Podręcznik dla studentów medycyny i lekarzy.
p-ISBN: 978-83-233-2958-9

POR
ORG
MRP
Adres url: http://www.wuj.pl
117/356

Swatowski Michał , Piwowar Monika , Roterman-Konieczna Irena , Porembski Krzysztof .
Exons as an units In the identification and visualisation protein regions.
W: Human Genome Meeting HGM 2011, Dubai, 14-17 March 2011 : program and abstract book
s. 177 : abstr. P72
SZZ
AWZ
118/356

Jurkowski W. , Kułaga T. , Roterman I[rena] .
Geometric parameters defining the structure of proteins - relation to early-stage folding step.
J. Biomol. Struct. Dyn.
2011 : Vol. 29, nr 1, s. 79-104, bibliogr. 50 poz.
ISSN: 0739-1102

AZ
ORG
APZ
119/356

Spólnik Paweł , Król Marcin , Stopa Barbara , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Zemanek Grzegorz , Jagusiak Anna , Piwowar Piotr , Szoniec Grzegorz , Roterman Irena .
Influence of the electric field on supramolecular structure and properties of amyloid-specific reagent Congo red.
Eur. Biophys. J.
2011 : Vol. 40, nr 10, s. 1187-1196, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0175-7571

AZ
ORG
AIF
IF: 2.139
120/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Banach Mateusz , Jurkowski Wiktor .
Intermediates in the protein folding process : a computational model.
Int. J. Mol. Sci.
2011 : Vol. 12, nr 8, s. 4850-4860, il., bibliogr. 22 poz., abstr.
p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 2.598
121/356

Marchewka Damian , Banach Mateusz , Roterman Irena .
Internal force field in proteins seen by divergence entropy.
Bioinformation
2011 : Vol. 6, nr 8, s. 300-302,, il., bibliogr. 27 poz., abstr.
p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
122/356

Marchewka Damian , Roterman Irena .
Internal force field in proteins.
W: Biotechno 2011 : The Third International Conference on Bioinformatics, Biocomputational Systems and Biotechnologies.
ed. Pei-Yuan Qian, Son V. Nghiem
Red Hook, NY : International Academy, Research, and Industry Association, 2011
s. 110-116 : il., bibliogr. 20 poz., abstr.
Venice/Mestre, Italy, May 22-27, 2011
p-ISBN: 978-1-61208-137-3

RZZ
ORG
RMZ
123/356

Roterman I[rena] , Konieczny L. , Jurkowski W[iktor] , Prymula K. , Banach M. .
Two-intermediate model to characterize the structure of fast-folding proteins.
J. Theor. Biol.
2011 : Vol. 283, nr 1, s. 60-70, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.208
124/356

Prymula Katarzyna , Sałapa Kinga , Roterman Irena .
"Fuzzy oil drop" model applied to individual small proteins built of 70 amino acids.
J. Mol. Model.
2010 : Vol. 16, nr 7, s. 1269-1282, il., bibliogr. 44 poz., abstr.
p-ISSN: 0949-183X

AZ
ORG
AIF
IF: 1.871
125/356

Księżyk Marek , Trąbka Jan , Żarnecki Andrzej , Tadeusiewicz Ryszard , Roterman Irena .
40 lat informatyki medycznej w Akademii Medycznej (aktualnie) Uniwersytet Jagielloński - Collegium Medicum.
(Forty years of medical informatics in Medical Academy (currently) Jagiellonian University - Medical College (JU CM).)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2010 : Vol. 6, nr 12 supl. 1, s. 27-28
MCSB 2010 : Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych.
SZP
AWZ
126/356

Chmielnicki Wiesław , Stąpor Katarzyna , Roterman-Konieczna Irena .
An efficient multi-class Support Vector Machine classifier for protein fold recognition.
W: Advances in Bioinformatics : 4th International Workshop on Practical Applications of Computational Biology and Bioinformatics 2010 (IWPACBB 2010).
eds. Miguel P. Rocha, Florentino Fernandez Riverola, Hagit Shatkay, Juan Manuel Corchado
Berlin : Springer, c2010
s. 77-84 : il., bibliogr. 20 poz., abstr.
p-ISBN: 978-3-642-13213-1

RZZ
ORG
RMZ
BB: Web of Science
Web of Science
127/356

Malawski Maciej , Gubała Tomasz , Jadczyk Tomasz , Prymula Katarzyna , Roterman Irena , Bubak Marian .
Application with Rich User Interface Powered by the GridSpace Virtual Laboratory.
W: Third ACC Cyfronet AGH Users' Conference, Zakopane, 18-19 March 2010 : proceedings
s. 55-56.
SZP
AWZ
128/356

Proszek Łukasz , Roterman Irena .
Automatyczna klasyfikacja algorytmem genetycznym struktur białkowych przy użyciu dopasowania sekwencji uzyskanej z transformacji gęstości hydrofobowości uzyskanej z modelu rozmytej kropli oliwy.
(Automatic Classification of Protein Structures based on Genetic Algorithm alignment of the Hydrophobicity Difference Profiles obtained from the Fuzzy Oil Drop Model.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2010 : Vol. 6, nr 12 supl. 1, s. 173-174
MCSB 2010 : Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych.
SZP
AWZ
129/356

Konieczny Leszek , Roterman Irena , Spólnik Paweł .
Biologia systemów : strategia działania organizmu żywego.
Warszawa : Wydawnictwo Naukowe PWN, 2010
XI : 215, [1] s. : il. ; 24 cm.
p-ISBN: 978-83-01-16392-1

PO
ORG
MP
130/356

Zobnina Veronica , Roterman Irena .
Development of the model for molecular dynamics simulation of membrane proteins to be incorporated to ViroLab Project.
W: Cracow '09 Grid Workshop, October 12-14, 2009 Cracow, Poland : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr.
Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2010
abstr. 2 : bibliogr. 7 poz.
SZP
AWZ
131/356

Guzik Piotr , Brongel Leszek , Roterman-Konieczna Irena , Sałapa Kinga , Budzyński Piotr , Jarzynowski Wiesław , Trybus Marek , Lorkowski Jacek .
Diagnostic groups of risk in trauma patients as independent groups of atients. Proposition for National Helth Founadtion. Clinical estimation costs of treatment. II. Direct and indirect costs of trauma.
Ostry Dyżur
2010 : T. 3, nr 3, s. 103-110, il., bibliogr. 39 poz.
p-ISSN: 1898-3316

AP
ORG
KBN
Adres url: http://ostrydyzur.net
132/356

Brongel Leszek , Guzik Piotr , Roterman-Konieczna Irena , Sałapa Kinga , Budzyński Piotr , Hładki Waldemar , Jarzynowski Wiesław , Trybus Marek .
Diagnostic groups of risk in trauma patients as independent homogenous groups of patients. Proposal for a catalogue for National Health Foundation. Clinical estimation of costs of treatment : I. Epidemiology of body injures.
Ostry Dyżur
2010 : T. 3, nr 3, s. 94-102, il., bibliogr. 35 poz.
p-ISSN: 1898-3316

AP
ORG
KBN
Adres url: http://ostrydyzur.net
133/356

Roterman-Konieczna Irena .
Editorial note.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2010 : Vol. 6, nr 12 supl. 1, s. 13
MCSB 2010 : Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych.
000
134/356

Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Król Marcin , Rybarska Janina , Jagusiak Anna , Spólnik Paweł , Roterman Irena , Urbanowicz Barbara , Piwowar Piotr , Lewiński Krzysztof .
Formation of amyloid-like aggregates through the attachment of protein molecules to a Congo red scaffolding framework ordered under the influence of an electric field.
Cent. Eur. J. Chem.
2010 : Vol. 8, nr 1, s. 41-50, il., bibliogr. 63 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 0.991
135/356

Banach Mateusz , Roterman Irena .
Identyfication of protein-protein complexation area.
W: Modeling & Design of Molecular Materials 2010, Wrocław, Poland, July 4-8, 2010 : conference information & abstracts
abstr. P1.
SZM
AWZ
136/356

Banach Mateusz , Roterman Irena .
Identyfikacja miejsc oddziaływań w kompleksach białko-białko.
(Identyfication of protein-protein complexation area.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2010 : Vol. 6, nr 12 supl. 1, s. 41-42
MCSB 2010 : Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych.
SZP
AWZ
137/356

Kononowicz Andrzej A. , Hege Inga , Adler Martin , de Leng Bas , Donkers Jeroen , Roterman Irena .
Integration Scenarios of Virtual Learning Environments with Virtual Patients Systems.
E-Mentor (Druk)
2010 : nr 5, s. 82-86, il., bibliogr. 18 poz.
AP
ORG
KBN
138/356

Prymula K. , Piwowar M[onika] , Kochanczyk M. , Flis L[ukasz] , Malawski M. , Szepieniec T. , Evangelista G. , Minervini G. , Polticelli F. , Wiśniowski Z[dzisław] , Sałapa K[inga] , Matczyńska E. , Roterman I[rena] .
Large scale computing to serach for pharmacologically active proteines.
W: Third ACC Cyfronet AGH Users' Conference, Zakopane, 18-19 March 2010 : proceedings
s. 12-13.
SZP
AWZ
139/356

Konieczny Leszek , Roterman Irena , Spólnik Paweł .
New challenges in computational biology.
W: Cracow '10 Grid Workshop, Kraków, Poland, October 11-13, 2010 : abstracts.
SZP
AWZ
140/356

Roterman-Konieczna Irena .
Statystyka na receptę : wprowadzenie do statystyki medycznej.
Kraków : Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2010
261 : [1] s. : il. ; 24 cm + dysk optyczny (CD-ROM)
(Medycyna - podręczniki akademickie).
p-ISBN: 978-83-233-2875-9

PO
ORG
MP
Adres url: http://www.wuj.pl
141/356

Marek Piotr , Roterman Irena .
Wewnętrzne pola siłowe w molekule białka.
(Internal force field in protein molecule.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2010 : Vol. 6, nr 12 supl. 1, s. 123-124
MCSB 2010 : Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych.
SZP
AWZ
142/356

Piłat Wiktor , Roterman Irena .
Wirtualna "gra" pomiędzy pacjentem i jego chorobą.
(In Silico "Game" between the patient and his/her disease.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2010 : Vol. 6, nr 12 supl. 1, s. 159-160
MCSB 2010 : Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych.
SZP
AWZ
143/356

Roterman Irena , Brylinski Michal , Konieczny Leszek .
Active site recognition in silico.
W: Structure-function relation in proteins / ed. Irena Roterman.
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
s. 105-127 : il., bibliogr. 67 poz., abstr.
RMZ
ORG
RMZ
144/356

Zobnina Veronica , Roterman Irena .
Application of the fuzzy-oil-drop model to membrane protein simulation.
Proteins
2009 : Vol. 77, nr 2, s. 378-394, il., bibliogr. 128 poz., abstr.
p-ISSN: 0887-3585

AZ
ORG
AIF
IF: 3.085
145/356

Banach Mateusz , Stąpor Katarzyna , Roterman Irena .
Chaperonin structure - the large multi-subunit protein complex.
Int. J. Mol. Sci.
2009 : Vol. 10, nr 3, s. 844-861, il., bibliogr. 31 poz., abstr.
p-ISSN: 1422-0067

AZ
ORG
AIF
IF: 0.978
146/356

Banach M. , Roterman I[rena] .
Chaperonin structure/function analysis according to hydrophobicity density distribution.
W: VIII European Symposium of the Protein Society, Zurich/Switzerland, June 14 - 18, 2009 : final program and book of abstracts
s. 153 : abstr. P 318.
SZZ
AWZ
147/356

Kononowicz Andrzej A. , Roterman Irena .
Chemical pathways - visualisation of classical analytical procedures in chemistry by the use of flow charts.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2009 : Vol. 5, nr 9, s. 121-126, il., bibliogr. 6 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
148/356

Konieczny Leszek , Spólnik Paweł , Roterman Irena .
Detektory biologiczne.
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały IX sympozjum : Krynica,10-14 maja 2009 r. / pod red. Janusza Gajdy.
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii AGH, 2009
s. 45-46 : il., bibliogr. 2 poz.
RZP
ORG
RMP
149/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Brylinski Michal .
Folding process in the presence of specific ligand.
W: Structure-function relation in proteins / ed. Irena Roterman.
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
s. 129-148 : il., bibliogr. 26 poz., abstr.
RMZ
ORG
RMZ
150/356

Prymula Katarzyna , Roterman Irena .
Functional characteristics of small proteins (70 amino acid residues) forming protein-nucleic acid complexes.
J. Biomol. Struct. Dyn.
2009 : Vol. 26, nr 6, s. 663-677, il., bibliogr. 38 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.124
151/356

Kochanczyk M. , Prymula K. , Broniatowska E[lżbieta] , Roterman I[rena] .
Fuzzy oil-drop model in the information-theoretic view for the protein function recognition.
W: VIII European Symposium of the Protein Society, Zurich/Switzerland, June 14 - 18, 2009 : final program and book of abstracts
s. 168 : abstr. P 369.
SZZ
AWZ
152/356

Matczynska E. , Piwowar M[onika] , Szepieniec T. , Roterman I[rena] .
Gene structure element sof "Never Born Proteins".
W: VIII European Symposium of the Protein Society, Zurich/Switzerland, June 14 - 18, 2009 : final program and book of abstracts
s. 90 : abstr. P 191.
SZZ
AWZ
153/356

Prymula Katarzyna , Piwowar Monika , Kochanczyk Marek , Flis Lukasz , Malawski Maciej , Szepieniec Tomasz , Evangelista Giovanni , Minervini Giuseppe , Polticelli Fabio , Wiśniowski Zdzisław , Sałapa Kinga , Matczyńska Ewa , Roterman Irena .
In silico structural study of random amino acid sequence proteins not present in nature.
Chem. Biodivers.
2009 : Vol. 6, nr 12, s. 2311-2336, il., bibliogr. 75 poz.
p-ISSN: 1612-1872

AZ
ORG
AIF
IF: 1.926
154/356

Zobnina Weronika , Roterman Irena .
Large-scale molecular dynamics simulation in pharmacology.
W: Druga Konferencja Użytkowników Komputerów Dużej Mocy, Zakopane, 12-13 marcca 2009
s. 65-67.
SZP
AWZ
155/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Brylinski Michal .
Late stage folding intermediate in silico model.
W: Structure-function relation in proteins / ed. Irena Roterman.
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
s. 79-103 : il., bibliogr. 48 poz., abstr.
RMZ
ORG
RMZ
156/356

Gorzelany Dorota , Walocha Jerzy , Wojas-Pelc Anna , Lejman Władysław , Gryglewski (hist.) Ryszard , Pyrczak Wiesław , Roterman Irena .
Male portrait head.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2009 : Vol. 5, nr 9, s. 137-141, bibliogr. 3 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
157/356

Piwowar Monika , Kułaga Tomasz , Jadczyk Tomasz , Malawski Maciej , Matczyńska Ewa , Piątkowska Weronika , Roterman Irena .
Microrray Data Analysis - two approaches.
W: Druga Konferencja Użytkowników Komputerów Dużej Mocy, Zakopane, 12-13 marcca 2009
s. 59-61.
SZP
AWZ
158/356

Proszek L. , Jurkowski W[iktor] , Roterman I[rena] .
Protein Knot-finder Webservice.
W: VIII European Symposium of the Protein Society, Zurich/Switzerland, June 14 - 18, 2009 : final program and book of abstracts
s. 159 : abstr. P 340.
SZZ
AWZ
159/356

Banach Mateusz , Roterman Irena .
Recognition of protein complexation based on hydrophobicity distribution.
Bioinformation
2009 : Vol. 4, nr 3, s. 98-100, il., bibliogr. 15 poz., abstr.
p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
160/356

Kononowicz Andrzej A. , Hege Inga , Adler Martin , Leng, de Bas , Donkers Jeroen , Roterman Irena .
Requirements on virtual learning environments generated by the use of virtual patients.
W: Druga Konferencja Użytkowników Komputerów Dużej Mocy, Zakopane, 12-13 marcca 2009
s. 52-54 : bibliogr. 8 poz.
SZP
AWZ
161/356

Stopa B[arbara] , Spólnik P[aweł] , Konieczny L. , Piekarska B[arbara] , Rybarska J. , Jagusiak J. [Anna] , Król M[arcin] , Roterman I[rena] .
Self-assembled organic molecules as non-standard protein ligands - Experimmental and computational studies.
W: Structure-function relation in proteins / ed. Irena Roterman.
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
s. 59-78 : il., bibliogr. 67 poz., abstr.
RMZ
ORG
RMZ
162/356

Jurkowski Wiktor , Porębski Grzegorz , Obtułowicz Krystyna , Roterman Irena .
Serum albumin complexation of acetylsalicylic Acid metabolites.
Curr. Drug Metab.
2009 : Vol. 10, nr 5, s. 448-458, il., bibliogr. 36 poz., abstr.
AZ
PRZ
AIF
IF: 3.989
163/356

Roterman-Konieczna Irena .
Statistics by prescription.
Kraków : Jagiellonian University Press, cop. 2009
267 : [1] s. : il. ; 24 cm + dysk optyczny (CD-ROM)
p-ISBN: 978-83-233-2741-7

MP
ORG
MP
164/356

Prymula Katarzyna , Roterman Irena .
Structural entropy to characterize small proteins (70 aa) and their interactions.
Entropy (Basel, Online)
2009 : Vol. 11, nr 1, s. 62-84, il., bibliogr. 53 poz., abstr.
AZ
ORG
APZ
165/356

Roterman I[rena] .
Structural information to characterize the step-wise model of protein folding process.
W: VIII European Symposium of the Protein Society, Zurich/Switzerland, June 14 - 18, 2009 : final program and book of abstracts
s. 40 : abstr. P 252.
SZZ
AWZ
166/356

Structure-function relation in proteins.
Irena Roterman
Trivandrum : Transworld Research Network, 2009
148 s.
p-ISBN: 978-81-7895-409-7

MRZ
ORG
MRZ
167/356

Kulaga T[omasz] , Jurkowski W[iktor] , Roterman I[rena] .
The geometric parameters to classify the structural motifs in proteins.
W: VIII European Symposium of the Protein Society, Zurich/Switzerland, June 14 - 18, 2009 : final program and book of abstracts
s. 153 : abstr. P 320.
SZZ
AWZ
168/356

Roterman Irena .
The XV century patients (as presented on Wit Stwosz altar) diagnozed.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2009 : Vol. 5, nr 9, s. 147-152, il., bibliogr. 4 poz.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
169/356

Kiełkowicz Piotr , Roterman Irena .
Unfolding simulation to verify the concept of limited conformational sub-space for early-stage intermediate.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2009 : Vol. 5, nr 10, s. 15-23, il., bibliogr. 29 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
170/356

Roterman Irena , Kononowicz Andrzej A. , Walecki Piotr , Lasoń Wojciech .
Wirtualni pacjenci jako przykład narzędzia symulacyjnego w edukacji medycznej.
W: Modelowanie i pomiary w medycynie : materiały IX sympozjum : Krynica,10-14 maja 2009 r. / pod red. Janusza Gajdy.
Kraków : Wydawnictwo Katedry Metrologii AGH, 2009
s. 41-44 : il., bibliogr. 18 poz., abstr., streszcz.
RZP
ORG
RMP
171/356

Roterman-Konieczna Irena .
Wirtualny apcjent.
Alma Mater (Krak.)
2009 : nr 119, s. 51-53, il.
000
Adres url: http://www3.uj.edu.pl/alma/alma/
172/356

Walecki Piotr , Lasoń Wojciech , Roterman-Konieczna Irena .
Advanced measurement of saccadic eye movements - study of invariable and significant physiological features.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2008 : Vol. 4, nr 8, s. 81-92, il., bibliogr. 17 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
173/356

Porębski Grzegorz , Obtułowicz Krystyna , Piwowar Monika , Roterman-Konieczna Irena .
Association Between the N-Acetylation Genetic Polymorphism and Aspiryn-Induced Urticartia.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2008 : Vol. 4, nr 8, s. 19-23, bibliogr. 31 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
174/356

Brylinski Michal , Konieczny Leszek , Kononowicz Andrzej , Roterman Irena .
Conservative secondary structure motifs already present in early-stage folding (in silico) as found in serpines family.
J. Theor. Biol.
2008 : Vol. 251, nr 2, s. 275-285, il., bibliogr., abstr.
p-ISSN: 0022-5193

AZ
ORG
AIF
IF: 2.454
175/356

Kononowicz Andrzej A. , Stachoń Aleksandra J. , Roterman-Konieczna Irena .
Czy przyszłością nauczania medycyny są wirtualne kliniki?
W: Postępy e-edukacji : praca zbiorowa / pod red. zespołu Ośrodka Kształcenia na Odległość OKNO PW ; [komitet red. Remigiusz Rak, Bogdan Galwas, Elżbieta Piwowarska].
Warszawa : Oficyna Wydawnicza Politechniki Warszawskiej, 2008
s. 317-325 : il., bibliogr. 13 poz.
RMP
ORG
RMP
176/356

Piwowar Monika , Szepieniec Tomasz , Matczyńska Ewa , Roterman Irena .
Identification of "never born" protein traces in human chromosome 1 with using Grid environment - preliminary analysis.
W: Cracow '07 Grid Workshop, October 15-17, 2007 Cracow, Poland : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr.
Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2008
s. 506-514 : il., bibliogr. 18 poz., abstr.
RZM
ORG
APZ
177/356

Roterman Irena .
Large scale computing in pharmacology.
W: Konferencja Użytkowników Komputerów Dużej Mocy, Zakopane, 6-7 marca 2008 : abstrakty.
bibliogr. 3 poz.
SZP
AWZ
178/356

Marchewka Damian , Roterman Irena .
Ligands Database.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2008 : Vol. 4, nr 8, s. 15-18, il., bibliogr. 10 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
179/356

Roterman I[rena] , Broniatowska E[lżbieta] .
Ligands naturally bond to proteins.
W: Current Trends in Theoretical Chemistry V, Kraków, Poland, 6-10 July, 2008 : book of abstracts
s. O23.
SZP
AWZ
180/356

Minervini Giovanni , Evangelista Giuseppe , Polticelli Fabio , Piwowar Monika , Kochanczyk Marek , Flis Łukasz , Malawski Maciej , Szepieniec Tomasz , Wiśniowski Zdzisław , Matczyńska Ewa , Prymula Katarzyna , Roterman Irena .
Never born proteins as a test case for ab initio protein structures prediction.
Bioinformation
2008 : Vol. 3, nr 4, s. 177-179, il., bibliogr. 9 poz., abstr.
p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.bioinformation.net
181/356

Trąbka Jan , Walecki Piotr , Sarapata Krzysztof , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena .
Percepcja mowy - analiza potencjałów wywołanych w zaburzeniach procesów przetwarzania słuchowego. COST BMO605 - Świadomość : Zintegrowane podejście interdyscyplinarne.
(Cost action BMO605: consciousness : a transdisciplinary, integrated approach.)
Episteme
2008 : nr 7, s. 83-94, bibliogr. 33 poz., streszcz.
AP
ORG
182/356

Piwowar Monika , Roterman Irena .
Projekt Sekwencjonowania Ludzkiego Genomu.
W: Inżynieria biomedyczna : księga współczesnej wiedzy tajemnej w wersji przystępnej i przyjemnej / pod red. nauk. Ryszarda Tadeusiewicza.
Kraków : AGH Uczelniane Wydawnictwa Naukowo-Dydaktyczne, 2008
il. : bibliogr. 24 poz.
Rozdział na CD.
RMP
ORG
RMP
183/356

Broniatowska Elżbieta , Roterman Irena .
Quantum chemistry calculations in pharmacology.
W: Modeling & Design of Molecular Materials 2008, Piechowice, 23-28 June 2008 : conference information & abstracts
abstr. P3/A.
SZM
AWZ
184/356

Stachoń Aleksandra J. , Kononowicz Andrzej A. , Roterman-Konieczna Irena , Hege Inga , Holzer Matthias , Adler Martin , Fischer Martin R. .
Scenarios for the implementation of VPs into the medical curriculum by the example of JUMC's participation in the eViP-Programme.
W: AMEE 2008, Prague, Czech Republic, 30 August to 3 September, 2008 : abstracts
s. 155 : abstr. 6C/SC1.
SZZ
AWZ
185/356

Kononowicz Andrzej , Roterman Irena .
Szpitalny System Obsługi Pacjenta.
W: Inżynieria biomedyczna : księga współczesnej wiedzy tajemnej w wersji przystępnej i przyjemnej / pod red. nauk. Ryszarda Tadeusiewicza.
Kraków : AGH Uczelniane Wydawnictwa Naukowo-Dydaktyczne, 2008
s. 166-177 : il., bibliogr. 29 poz.
RMP
ORG
RMP
186/356

Poulton Terry , Fors Uno , Fischer Martin , Davies David , Leng, de Bas , Huwendiek Soeren , Muntean Valentin , Roterman Irena , Balasubramaniam Chara .
The European electronic Virtual Patient programme - the story so far.
W: AMEE 2008, Prague, Czech Republic, 30 August to 3 September, 2008 : abstracts
s. 289 : abstr. 9C/SC6.
SZZ
AWZ
187/356

Walecki Piotr , Lasoń Wojciech , Gorzelańczyk Edward J. , Roterman Irena .
The influence of coffee on an eyeball movement.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2008 : Vol. 4, nr 8, s. 69-72, il., bibliogr. 11 poz., abstr.
p-ISSN: 1896-530X

AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
188/356

Roterman-Konieczna Irena , Kononowicz Andrzej A. , Stachoń Aleksandra J. .
Wirtualny pacjent jako narzędzie nauczania problemowego w kontekście europejskiego projektu eViP.
(Virtual Patient as a Tool for Problem Based-Learning in the Context of the European Project eViP.)
E-Mentor (Druk)
2008 : nr 1, s. 26-30, il., bibliogr.
AP
ORG
KBN
189/356

Malawski M. , Szepieniec T. , Kochanczyk M. , Piwowar M[onika] , Roterman I[rena] .
An approach to protein folding on the grid - EUChinaGrid experience.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2007 : Vol. 3, nr 5, s. 45-49, il., bibliogr. 18 poz., abstr.
AP
ORG
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
190/356

Flis Ł[ukasz] , Jurkowski W[iktor] , Prymula K. , Broniatowska E[lżbieta] , Kochańczyk M. , Roterman I[rena] .
Dynamics of early stage structural forms - never born proteins (NBP) - III.
W: VII European Symposium of the Protein Society - From Proteins to Proteome, Stockholm/Uppsala, Sweden, May 12-16 2007 : final program and abstractbook
s. 37 : abstr. I-2.
SZZ
AWZ
191/356

Roterman-Konieczna Irena .
Działalność naukowa Profesora Jana Jakuba Trąbki.
(Profesor Jan Jakub Trąbka Scientyfic Research.)
Episteme
2007 : nr 4, s. 191-193.
AP
POP
192/356

Roterman Irena .
E-infrastructure technologies triggering Bioinformatics development.
Bioinformation
2007 : Vol. 2, nr 4, s. 126-127.
p-ISSN: 0973-2063

AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.bioinformation.net/
193/356

Roterman I[rena] , Brylinski M[ichał] , Konieczny L. , Jurkowski W[iktor] .
Early-stage protein folding - In silico model.
W: Recent advances in structural bioinformatics / ed. Alexandre G. de Brever.
Trivandrum, Kerala, India : Research Signpost, 2007
s. 1-35 : il., bibliogr. 70 poz.
RMZ
ORG
RMZ
194/356

Konieczny L. , Piekarska B[arbara] , Rybarska J. , Stopa B[arbara] , Spólnik P[aweł] , Jagusiak A[nna] , Zemanek G[rzegorz] , Król M[arcin] , Roterman I[rena] .
Fibrillar nano-particles of bis-azo-dyes as the specific, single protein ligands.
W: Supramolecular Chemistry and Advanced Materials : 9th Polish Supramolecular Chemistry Network Conference Nano2007, Koninki 2007
s. 128-130 : il., bibliogr. 9 poz.
SZP
AWZ
195/356

Brylinski Michal , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Is the protein folding an aim-oriented process? Human haemoglobin as example.
Int. J. Bioinformatics Res. Appl.
2007 : Vol. 3, nr 2, s. 234-260, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url: http://inderscience.metapress.com/app/home/main.asp
196/356

Wisniowski Z[dzisław] , Malawski M. , Szepieniec T. , Kochanczyk M. , Flis L[ukasz] , Prymula K. , Jurkowski W[iktor] , Broniatowska E[lżbieta] , Piwowar M[onika] , Roterman-Konieczna I[rena] .
Large scale pharmacological experiment on the GRID - protein folding in EUChinaGRID.
W: OGF20 : EGEE Second User Forum, Manchester, United Kingdom, May -7-11, 2007
s. 118-119 : abstr. 69.
SZZ
AWZ
197/356

Brylinski Michal , Kochanczyk Marek , Broniatowska Elzbieta , Roterman Irena .
Localization of ligand binding site in proteins identified in silico.
J. Mol. Model.
2007 : Vol. 13, nr 6-7, s. 665-675, il., bibliogr. 96 poz., abstr.
p-ISSN: 0949-183X

AZ
ORG
AIF
IF: 1.669
Adres url: http://www.springerlink.com/content/100529/
198/356

Piwowar Monika , Szepieniec Tomasz , Roterman Irena .
Massive identification of similarities in DNA materials organized in Grid environment.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2007 : Vol. 3, nr 5, s. 51-52, bibliogr. 10 poz.
AP
ORG
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
199/356

Bryliński Michał , Prymula Katarzyna , Jurkowski Wiktor , Kochańczyk Marek , Stawowczyk Ewa , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Prediction of functional sites based on the fuzzy oil drop model.
PLoS Comput. Biol.
2007 : Vol. 3, nr 5, s. 909-923, il., bibliogr. 80 poz.
p-ISSN: 1553-734X

AZ
ORG
AIF
IF: 6.236
Adres url: http://compbiol.plosjournals.org/
200/356

Jurkowski W[iktor] , Flis Ł[ukasz] , Broniatowska E[lżbieta] , Prymula K. , Kochańczyk M. , Roterman I[rena] .
Protein folding intermediate - early stage (ES) - loop identification - never born proteins (NBP) - II.
W: VII European Symposium of the Protein Society - From Proteins to Proteome, Stockholm/Uppsala, Sweden, May 12-16 2007 : final program and abstractbook
s. 292 : abstr. III-7.
SZZ
AWZ
201/356

Roterman I[rena] , Flis Ł[ukasz] , Jurkowski W[iktor] , Prymula K. , Broniatowska E[lżbieta] , Kochańczyk M. .
Protein folding simulation rather than protein structure prediction - application to never born proteins (NBP) - I.
W: VII European Symposium of the Protein Society - From Proteins to Proteome, Stockholm/Uppsala, Sweden, May 12-16 2007 : final program and abstractbook
s. 297 : abstr. II-12.
SZZ
AWZ
202/356

Drozd Anna , Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Krol Marcin , Jurkowski Wiktor , Roterman Irena , Stopa Barbara , Rybarska Janina .
The long-distance structural Ganges in antibodies. Studies by Congo red binding and molecular modeling.
Acta Biochim. Pol.
2007 : Vol. 54 suppl. 2, s. 13, abstr. P1.10
6th Parnas Conference Molecular Mechanism of Cellular Signalling, Kraków, Poland, May 30th - June 2nd, 2007.
SZP
SIF
203/356

Malawski M. , Szepieniec T. , Kochanczyk M. , Piwowar M[onika] , Roterman-Konieczna I[rena] .
The quest for pharmacology active never born proteins within the EUChinaGRID Project.
W: Cracow '06 Grid Workshop, October 15-18, 2006, Cracow, Poland : proceedings/ eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr.
Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2007
s. 505-510 : il., bibliogr. 19 poz., abstr.
RZM
ORG
APZ
204/356

Spólnik Paweł , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Jagusiak Anna , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Król Marcin , Roterman Irena , Urbanowicz Barbara , Zięba-Palus Janina .
The Use of Rigid, Fibrillar Congo Red Nanostructures for Scaffolding Protein Assemblies and Inducing the Formation of Amyloid-like Arrangement of Molecules.
Chem. Biol. Drug Des.
2007 : Vol. 70, nr 6, s. 491-501, il., bibliogr. 66 poz.
p-ISSN: 1747-0277

AZ
ORG
AIF
IF: 2.043
Adres url: http://www.blackwell-synergy.com/loi/jpp
205/356

Kononowicz Andrzej , Obtułowicz Piotr , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena .
Two years' experience of medical e-learning.
W: European Interprofessional Education Network First International Conference : Learning together to work together, Krakow, Poland, 12-14 September 2007 : conference handbook
s. 85.
SZM
AWZ
206/356

Meus Jan , Brylinski [Bryliński] Michał , Piwowar Monika , Piwowar Piotr , Wiśniowski Zdzisław , Stefaniak Justyna , Konieczny Leszek , Surówka Grzegorz , Roterman Irena .
A tabular approach to the sequence-to-structure relation in proteins (tetrapeptide representation) for de novo protein design.
Med. Sci. Monit.
2006 : Vol. 12, nr 6, s. BR208-214, il., bibliogr. 44 poz., summ.
AP
ORG
AIF
IF: 1.595
Adres url: http://www.medscimonit.com
207/356

Stopa Barbara , Rybarska Janina , Drozd Anna , Konieczny Leszek , Król Marcin , Lisowski Marek , Piekarska Barbara , Roterman Irena , Spólnik Paweł , Zemanek Grzegorz .
Albumin binds self-assembling dyes as specific polymolecular ligands.
Int. J. Biol. Macromol.
2006 : Vol. 40, nr 1, s. 1-8, il., bibliogr. 52 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.323
208/356

Roterman Irena , Bryliński Michał .
Co to jest bioinformatyka?
Pomiary, Autom., Kontr.
2006 : nr 5'bis wyd. spec. dodatkowe, s. 5-7, il., bibliogr. 12 poz., abstr., streszcz.
VIII Sympozjum Modelowanie i Pomiary w Medycynie, Krynica, 14-18 maja 2006 r.
RZP
PRZ
KBN
Adres url: http://www.pak.home.pl
209/356

Roterman-Konieczna Irena .
Computer modeling in drug design.
W: Cracow Computational Science Workshop, Cracow, Poland, april 3-4, 2006.
SZP
AWZ
210/356

Kononowicz Andrzej A. , Roterman-Konieczna Irena .
E-learning as a new tool in medicine teaching on the example of an introductory statistics course.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2006 : Vol. 2, nr 3, s. 61-65, il., bibliogr. 6 poz., abstr.
AP
ORG
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
211/356

Kononowicz Andrzej , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena .
E-learning in medicine.
Probl. Higieny Epidemiol.
2006 : T. 87, nr 4, s. 364-371, il., bibliogr. 20 poz.
Poprzednio Probl. Hig. British-Polish Conference : Interdisciplinary teaching - contemporary challenges for teachers and students, Krakow, September, 14th-15th, 2006.
RZM
PRZ
KBN
Adres url: http://www.phie.pl
212/356

Lasoń Wojciech , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena .
Edukacja przyszłości - e-Learning i Telemedycyna.
(Education of the Future - e-Learning and Telemedicine.)
Krak. Stud. Małop.
2006 : nr 10, s. 275-282, bibliogr.
AP
POP
213/356

Roterman-Konieczna Irena .
EUChinaGrid.
Alma Mater (Krak.)
2006 : nr 83, s. 77.
AP
Adres url: http://www3.uj.edu.pl/alma/alma/
214/356

Brylinski Michal , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Fuzzy-oil-drop hydrophobic force field--a model to represent late-stage folding (in silico) of lysozyme.
J. Biomol. Struct. Dyn.
2006 : Vol. 23, nr 5, s. 519-528, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.299
Adres url: http://www.jbsdonline.com
215/356

Konieczny Leszek , Brylinski Michal , Roterman Irena .
Gauss-function-based model of hydrophobicity density in proteins.
In Silico Biol.
2006 : Vol. 6, nr 1-2, s. 15-22, il., bibliogr. 36 poz., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.bioinfo.de/isb
216/356

Malawski Maciej , Szepieniec Tomasz , Roterman-Konieczna Irena .
Grid systems and their applications to biomedical science.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2006 : Vol. 2, nr 3, s. 43-46, il., bibliogr., abstr., streszcz.
AP
ORG
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
217/356

Brylinski Michal , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Hydrophobic collapse in (in silico) protein folding.
Comput. Biol. Chem.
2006 : Vol. 30, nr 4, s. 255-267, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.135
218/356

Brylinski Michal , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Hydrophobic collapse in late-stage folding (in silico) of bovine pancreatic trypsin inhibitor.
Biochimie
2006 : Vol. 88, nr 9, s. 1229-1239, il., bibliogr. 91 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 3.237
Adres url: http://www.elsevier.com
219/356

Sarapata Krzysztof , Walecki Piotr , Lasoń Wojciech , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena .
Kliniczne bazy danych w metodologii EBM.
(Clinical Database Based on EBM Methodology.)
Episteme
2006 : nr 3, s. 121-139, il., bibliogr. 22 poz., abstr.
AP
POP
220/356

Brylinski [Bryliński] Michal [Michał] , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Ligation site in proteins recognized in silico.
Bioinformation
2006 : Vol. 1, nr 4, s. 127-129, il., bibliogr. 17 poz., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.bioinformation.net/
221/356

Lasoń Wojciech , Walecki Piotr , Sarapata Krzysztof , Roterman-Konieczna Irena .
Nauczanie medycyny z wykorzystaniem paradygmatu Medycyny Opartej na Dowodach Naukowych (Evidence Based Medicine).
W: Komputer w edukacji : 16. ogólnopolskie sympozjum naukowe, Kraków 29-30 września 2006 / red. nauk. Janusz Morbitzer.
Kraków : Pracownia Technologii Nauczania AP, 2006
s. 125-130 : il., bibliogr.
RZP
ORG
RMP
222/356

Broniatowska Elżbieta , Stępień O[lga] , Roterman Irena .
PLDB - Protein Ligands DataBase.
W: Modeling & Design of Molecular Materials 2006, Wrocław, 10-15 September 2006 : program and book of abstracts
abstr. P3.
SZM
AWZ
223/356

Sarapata Krzysztof , Usarz Marcin , Trąbka Jan , Walecki Piotr , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena .
Security of net servers in biological approach.
Artificial Intelligence Studies
2004 : Vol. 1 (23), s. 31-38, bibliogr. 12 poz.
VI International Conference on Artificial Inteligence AI-19'2004.
AP
ORG
224/356

Brylinski [Bryliński] Michal [Michał] , Kochanczyk Marek , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Sequence-structure-function relation characterized in silico.
In Silico Biol.
2006 : Vol. 6, nr 6, s. 589-600, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.bioinfo.de/isb
225/356

Roterman Irena , Bryliński M[ichał] , Jurkowski W[iktor] .
Simulation of protein folding process.
W: 3rd Central european Conference Chemistry Towards Biology, Kraków, September 8th-12th, 2006
abstr. O-19 : bibliogr. 6 poz.
SZP
AWZ
226/356

Walecki Piotr , Lasoń Wojciech , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena , Sarapata Krzysztof .
Szpitalny system informacyjny (HIS) oparty na metodologii EBM.
W: Pozyskiwanie wiedzy i zarządzanie wiedzą / red. nauk. Małgorzata Nycz, Mieczysław Lech Owoc.
Wrocław : Wydawnictwo Akademii Ekonomicznej im. Oskara Langego, 2006
s. 168-178 : il., bibliogr.
(Prace Naukowe Akademii Ekonomicznej im. Oskara Langego we Wrocławiu, nr 1121) .
RMP
ORG
RMP
227/356

Piwowar Monika , Meus Jan , Piwowar Piotr , Wiśniowski Zdzisław , Stefaniak Justyna , Roterman Irena .
Tandemly repeated trinucleotides - comparative analysis.
Acta Biochim. Pol.
2006 : Vol. 53, nr 2, s. 279-287, il., bibliogr.
AP
ORG
AIF
IF: 1.363
Adres url: http://www.actabp.pl
228/356

Krol Marcin , Roterman Irena , Drozd Anna , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Spolnik Pawel , Stopa Barbara .
The increased flexibility of CDR loops generated in antibodies by Congo red complexation favors antigen binding.
J. Biomol. Struct. Dyn.
2006 : Vol. 23, nr 4, s. 407-416, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.299
Adres url: http://www.jbsdonline.com
229/356

Piekarska Barbara , Drozd Anna , Konieczny Leszek , Król Marcin , Jurkowski Wiktor , Roterman Irena , Spólnik Paweł , Stopa Barbara , Rybarska Janina .
The indirect generation of long-distance structural changes in antibodies upon their binding to antigen.
Chem. Biol. Drug Des.
2006 : Vol. 68, nr 5, s. 276-283, il., bibliogr. 61 poz.
AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.blackwell-synergy.com/loi/jpp
230/356

Broniatowska Elżbieta , Stępień Olga , Roterman Irena .
The ligand database serwer.
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2006 : Vol. 2, nr 4, s. 21-24, il., bibliogr. 10 poz., abstr., streszcz.
AP
ORG
231/356

Roterman-Konieczna Irena , Kochanczyk Marek , Malawski Maciej , Piwowar Monika , Szepieniec Tomasz .
The Quest for Pharmacology Active 'Never Born Proteins' within EUChinaGRID Project.
W: Cracow '06 Grid Workshop, Cracow, Poland, October 15-18, 2006 : abstracts
abstr. 22.
SZP
AWZ
232/356

Spólnik Paweł , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Drozd Anna , Król Marcin , Roterman Irena , Wolska-Smoleń Teresa , Skotnicki Aleksander B[artłomiej] .
The use of the Congo red-related dye DBACR to recognize the heavy chain-derived abnormality of myeloma immunoglobulins.
Arch. Immunol. Ther. Exp.
2006 : Vol. 54, nr 3, s. 217-221, il., bibliogr. 18 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 1.635
Adres url: http://www.springerlink.com/content/1661-4917/
233/356

Kononowicz Andrzej , Zabińska-Popiela Marta , Roterman-Konieczna Irena , Krzysiek Józef .
A case-based examination system with multiple answer paths.
W: AMEE 2005, Amsterdam, The Netherlands, 30 August - 3 September, 2005 : abstracts
s. 34 : abstr. 2 Topaz 2.9.
SZZ
AWZ
234/356

Król Marcin , Roterman Irena , Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Spólnik Paweł , Szneler Edward .
An approach to understand the complexation of supramolecular dye Congo red with immunoglobulin L chain λ.
Biopolymers
2005 : Vol. 77, nr 3, s. 155-162, il., bibliogr. 28 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.545
Adres url: http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/jhome/28380
235/356

Król Marcin , Roterman Irena , Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Spólnik Paweł .
Analysis of correlated domain motions in IgG light chain reveals possible mechanisms of immunological signal transduction.
Proteins
2005 : Vol. 59, nr 3, s. 545-554, il., bibliogr. 71 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 4.684
Adres url: http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/jtoc/36176/
236/356

Brylinski Michal , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
CASP6 - our best approach.
W: VIth European Symposium of the Protein Society, Barcelona, 30 April - 4 May, 2005 : final program and abstracts
s. 94 : abstr. 05-5.
SZZ
AWZ
237/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Brylinski Michal .
CASP6 - our worst approach.
W: VIth European Symposium of the Protein Society, Barcelona, 30 April - 4 May, 2005 : final program and abstracts
s. 94 : abstr. 05-6.
SZZ
AWZ
238/356

Piekarska B[arbara] , Stopa B[arbara] , Konieczny L. , Rybarska J. , Zemanek G[rzegorz] , Spólnik P[aweł] , Roterman I[rena] , Król Marcin .
Complexation of supramolecular dye Congo red with immunoglobulins. The possible mechanism of dye-induced stabilization of antigen-antibody complexes.
FEBS J.
2005 : Vol. 272 suppl. 1, s. 74, abstr. A1-024P
30th FEBS Congress and 9th IUBMB Conference "The Protein World", Budapest, Hungary, 2-7 July, 2005.
SZZ
AWZ
239/356

Spólnik P[aweł] , Konieczny L. , Piekarska B[arbara] , Rybarska J. , Stopa B[arbara] , Zemanek G[rzegorz] , Drozd A[nna] , Król M[arcin] , Roterman I[rena] , Wolska-Smoleń T[eresa] , Skotnicki A[leksander] B. .
Congo red-derived supramolecular dyes as probes for disclosure of the aggregation tendency of abnormal monoclonal immunoglobulins.
Pol. J. Environ. Stud.
2005 : Vol. 14 suppl. 2, s. 776-781, il., bibliogr. 25 poz., abstr.
AP
PRZ
AIF
IF: 0.352
240/356

Matuszewski Przemysław , Bach Ewa , Łasocha Bartłomiej , Koleszyńska Joanna , Roterman-Konieczna opiekun Irena , Sarapata opiekun Krzysztof .
Cukrzyca - ujęcie cybernetyczne.
Prz. Lek.
2005 : T. 62 supl. 1, s. 37, abstr. 146
Międzynarodowa Konferencja Naukowa Studentów Uczelni Medycznych, Kraków, 21-23 kwietnia 2005.
SZP
AWZ
Adres url: http://www.wydplek.com.pl
241/356

Brylinski Michal , Konieczny Leszek , Czerwonko Patryk , Jurkowski Wiktor , Roterman Irena .
Early-stage folding in proteins (in silico) sequence-to-structure relation.
J. Biomed. Biotechnol.
2005 : Vol. 2005, nr 2, s. 65-79, il., bibliogr. 80 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.812
Adres url: http://www.hindawi.com/journals/jbb/
242/356

Grzybowski Piotr , Gorzelańczyk Edward Jacek , Roterman-Konieczna Irena .
Genetyczne podłoże ADHD.
Krak. Stud. Małop.
2005 : nr 9, s. 257-266, bibliogr. 55 poz., summ.
AP
POP
243/356

Porebski G[rzegorz] , Obtulowicz K[rystyna] , Obtułowicz P[iotr] , Walecki P[iotr] , Roterman-Konieczna I[rena] .
Internet as a potential source of information about allergy for patients.
Allergy Clin. Immunol. Int.
2005 : Vol. 17 suppl. 1, s. 555, abstr. 1555.
World Allergy Congress, XIXth World Allergy Organization Congress, XXIVth Congress of the European Academy of Allergology and Clinical Immunology (EAACI), Munich, Germany, June 26 - July 1, 2005.
SZZ
AWZ
244/356

Drozd Anna , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Roterman Irena , Król Marcin , Spólnik Paweł , Zemanek Grzegorz .
Kompleksy białek i układów ciekłokrystalicznych. Możliwość zastosowań praktycznych.
(Specific supramolecular ligands with proteins. Possible practical application.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2005 : Vol. 1, nr 1-2, s. 113-116, il., bibliogr. 28 poz., abstr., streszcz.
AP
PRZ
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
245/356

Lasoń Wojciech , Walecki Piotr , Pyrczak Wiesław , Sarapata Krzysztof , Roterman-Konieczna Irena .
Medycyna Oparta na Dowodach (EBM) - nowe podejścia optymalizacyjne wykorzystujące systemy komputerowe.
W: Computer methods and systems = Metody i systemy komputerowe : CMS'05 : V konferencja, 14-16 November 2005, Kraków, Poland. Vol. 2, Regular sessions / ed. by Ryszard Tadeusiewicz, Antoni Ligęza, Maciej Szymkat ; AGH University of Science and Technology Cracow, Jagiellonian University, Cracow University of Technology.
Kraków : Oprogramowanie Naukowo-Techniczne, 2005
s. 455-462 : il., bibliogr. 29 poz., streszcz.
RZP
ORG
RMP
246/356

Roterman-Konieczna Irena .
Podstawowa analiza opisowa danych.
W: Podstawy informatyki z elementami telemedycyny : ćwiczenia dla studentów medycyny / pod red. Joanny Martyniak. - Kraków : Wydaw. Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2005
s. 59-65 : il.
RPO
ORG
RMP
247/356

Roterman-Konieczna Irena .
Podstawy statystyki opisowej.
W: Podstawy informatyki z elementami telemedycyny : ćwiczenia dla studentów medycyny / pod red. Joanny Martyniak. - Kraków : Wydaw. Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2005
s. 66-70 : il.
RPO
ORG
RMP
248/356

Piwowar Monika , Meus Jan , Harańczyk Grzegorz , Piwowar Piotr , Roterman Irena .
Polimorphism of tandemly repeated trinucleotides, in the context of dynamic mutations.
W: VIth European Symposium of the Protein Society, Barcelona, 30 April - 4 May, 2005 : final program and abstracts
s. 83 : abstr. 04-5.
SZZ
AWZ
249/356

Jurkowski Wiktor , Roterman Irena , Konieczny Leszek .
Protein active site in the early-stage folding structure.
W: VIth European Symposium of the Protein Society, Barcelona, 30 April - 4 May, 2005 : final program and abstracts
s. 94 : abstr. 05-8.
SZZ
AWZ
250/356

Martyniak Joanna , Roterman-Konieczna Irena .
Przystępujemy do analizy statystycznej.
W: Biostatystyka / pod red. Andrzeja Stanisza. - Kraków : Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2005
s. 11-29 : il., bibliogr.
RPO
ORG
RMP
251/356

Roterman-Konieczna Irena .
Rozkład empiryczny wielkości mierzalnej.
W: Podstawy informatyki z elementami telemedycyny : ćwiczenia dla studentów medycyny / pod red. Joanny Martyniak. - Kraków : Wydaw. Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2005
s. 79-86 : il.
RPO
ORG
RMP
252/356

Roterman-Konieczna Irena .
Rozkład normalny.
W: Podstawy informatyki z elementami telemedycyny : ćwiczenia dla studentów medycyny / pod red. Joanny Martyniak. - Kraków : Wydaw. Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2005
s. 87-94 : il.
RPO
ORG
RMP
253/356

Bryliński Michał , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
SPI - Structure predictability index for protein sequences.
In Silico Biol.
2005 : Vol. 5, nr 3, s. 227-237, il., bibliogr. 45 poz., abstr.
AZ
ORG
APZ
Adres url: http://www.bioinfo.de/isb
254/356

Roterman-Konieczna Irena .
Test sprawdzający typ rozkładu cechy mierzalnej. Test chi-kwadrat (χ2).
W: Biostatystyka / pod red. Andrzeja Stanisza. - Kraków : Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2005
s. 71-100 : il., bibliogr.
RPO
ORG
RMP
255/356

Rybarska Janina , Spólnik Paweł , Drozd Anna , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Król Marcin , Roterman-Konieczna Irena .
Tworzenie i rozdział kompleksów białek surowicy z barwnikami supramolekularnymi w elektroforezie dwukierunkowej - próba opracowania komputerowej techniki analizy obrazu rozdziałowego.
(Protein complexes with supramolecular ligands formed and revealed in two-dimensional electrophoresis. The search for computer analysis of results.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2005 : Vol. 1, nr 1-2, s. 133-138, il., bibliogr. 40 poz., abstr., streszcz.
AP
PRZ
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
256/356

Kononowicz Andrzej , Żabińska-Popiela Marta , Roterman-Konieczna Irena , Krzysiek Józef .
Wspomagany komputerowo wielościeżkowy system egzaminowania studentów medycyny.
(A multi-path computer-based examination system for students of medicine.)
W: Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych : Ogólnopolska Konferencja Naukowa, Kraków, 20-21 maja 2005 : materiały konferencyjne
s. 36.
SZP
AWZ
257/356

Kononowicz Andrzej , Żabińska-Popiela Marta , Roterman-Konieczna Irena , Krzysiek Józef .
Wspomagany komputerowo wielościeżkowy system egzaminowania studentów medycyny.
(A multi-path computer-based examination system for students of medicine.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2005 : Vol. 1, nr 1-2, s. 165-170, il., abstr., streszcz.
AP
ORG
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
258/356

Wstęp.
W: Podstawy informatyki z elementami telemedycyny : ćwiczenia dla studentów medycyny / pod red. Joanny Martyniak. - Kraków : Wydaw. Uniwersytetu Jagiellońskiego, cop. 2005
s. 7-8.
000
259/356

Sarapata Krzysztof , Bilo Grzegorz , Pyrczak Wiesław , Kononowicz Andrzej , Roterman-Konieczna Irena , Kawecka-Jaszcz Kalina .
Zastosowanie kryptografii w telekonsultacji kardiologicznej.
(Application of cryptography in cardiologic teleconsultation.)
Bio-Algorithms Med-Syst. (Print)
2005 : Vol. 1, nr 1-2, s. 365-368, il., bibliogr. 7 poz., abstr.
AP
ORG
Adres url: http://www.bams.cm-uj.krakow.pl
260/356

Sarapata Krzysztof , Bilo Grzegorz , Pyrczak Wiesław , Kononowicz Andrzej , Roterman-Konieczna Irena , Kawecka-Jaszcz Kalina .
Zastosowanie kryptografii w telekonsultacji kardiologicznej.
(Application of Cryptography in Cardiologic Teleconsultation.)
W: Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych : Ogólnopolska Konferencja Naukowa, Kraków, 20-21 maja 2005 : materiały konferencyjne
s. 80.
SZP
AWZ
261/356

Walecki Piotr , Lasoń Wojciech , Wiśniowski Zdzisław , Roterman-Konieczna Irena .
Abductive logic programming in medical diagnosis.
Journal of Artificial Intelligence
2004 : Vol. 1, nr 2, s. 107-115, il., bibliogr. 18 poz., abstr.
AP
ORG
262/356

Piwowar Monika , Meus Jan , Roterman Irena .
Analiza zawartości mikrosatelitów (CAG)n w genomach wybranych organizmów oraz w mRNA ludzkim.
W: SIIB 2004 [Dokument elektroniczny] : Sztuczna Inteligencja w Inżynierii Biomedycznej : Kraków 19.X.2004. - Zabierzów : preTEXt wydaw., 2004.
DE
AWZ
263/356

Jurkowski Wiktor , Brylinski Michał , Konieczny Leszek , Wiiniowski [Wiśniowski] Zdzisław , Roterman Irena .
Conformational subspace in simulation of early-stage protein folding.
Proteins
2004 : Vol. 55, nr 1, s. 115-127, il., bibliogr. 35 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 4.429
Adres url: http://www3.interscience.wiley.com/cgi-bin/jtoc/36176/
264/356

Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena , Łasocha Bartłomiej , Matuszewski Przemysław .
E-learning w naukach medycznych.
Krak. Stud. Małop.
2004 : nr 8, s. 403-412, il., bibliogr. 8 poz., summ.
AP
POP
265/356

Łasocha Bartłomiej , Matuszewski Przemysław , Pietruszka Szymon , Roterman-Konieczna opiekun Irena , Pyrczak Wiesław .
E-learning w zakresie problematyki raka piersi.
Prz. Lek.
2004 : T. 61 supl. 1, s. 64, abstr. 253
Międzynarodowa Konferencja Naukowa Studentów Uczelni Medycznych, Kraków, 1-3 kwietnia 2004.
SZM
AWZ
Adres url: http://www.wydplek.com.pl
266/356

Król Marcin , Borowski Tomasz , Roterman Irena , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Rybarska Joanna , Konieczny Leszek .
Force-field parametrization and molecular dynamics simulations of Congo red.
J. Comput. Aided Mol. Des.
2004 : Vol. 18, nr 1, s. 41-53, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.729
267/356

Rybarska Janina , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Spólnik Paweł , Zemanek Grzegorz , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
In vivo accumulation of self-assembling dye Congo red in an area marked by specific immune complexes : possible relevance to chemotherapy.
Folia Histochem. Cytobiol.
2004 : Vol. 42, nr 2, s. 101-110, il., bibliogr. 48 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.672
Adres url: http://www.cm-uj.krakow.pl/FHC
268/356

Spólnik Paweł , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Król Marcin , Roterman Irena .
Instability of monoclonal myeloma protein may be identified as susceptibility to penetration and binding by newly synthesized Congo red derivatives.
Biochimie
2004 : Vol. 86, nr 6, s. 397-402, il., bibliogr. 10 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 3.814
Adres url: http://www.elsevier.com
269/356

Piekarska B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J. , Stopa B[arbara] , Spólnik P[aweł] , Roterman I[rena] , Król M[arcin] .
Intramolecular signaling in immunoglobulins - new evidence emerging from the use of supramolecular protein ligands.
J. Physiol. Pharmacol.
2004 : Vol. 55, nr 3, s. 487-501, il., bibliogr. 83 poz.
AP
PRZ
AIF
IF: 2.328
Adres url: http://www.jpp.krakow.pl
270/356

Bryliński Michał , Jurkowski Wiktor , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Limitation of conformational space for proteins - early stage holding simulation of human α and β hemoglobin chains.
T.A.S.K. Q.
2004 : Vol. 8, nr 3, s. 413-422, bibliogr.
AP
ORG
KBN
271/356

Bryliński M[ichał] , Jurkowski W[iktor] , Konieczny L[eszek] , Roterman I[rena] .
Limited conformational space for early-stage protein folding simulation.
Bioinformatics
2004 : Vol. 20, nr 2, s. 199-205, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 5.742
Adres url: http://bioinformatics.oupjournals.org
272/356

Jurkowski W[iktor] , Bryliński M[ichał] , Konieczny L[eszek] , Roterman I[rena] .
Lysozyme folded in silico according to the limited conformational sub-space.
J. Biomol. Struct. Dyn.
2004 : Vol. 22, nr 2, s. 149-158, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.113
Adres url: http://www.jbsdonline.com
273/356

Sarapata Krzysztof , Szybiński Zbigniew , Roterman-Konieczna Irena , Lasoń Wojciech .
Prewencja zachorowań na raka tarczycy.
Krak. Stud. Małop.
2004 : nr 8, 413-422, il., bibliogr. 12 poz., summ.
AP
POP
274/356

Roterman-Konieczna Irena .
Survival analysis in SAS.
W: 13th International Workshop on Matrices and Statistics : in Celebration of Ingram Olkin's 80th Birthday, Będlewo, August 18-21, 2004 : program and abstracts
s. 133.
SZM
AWZ
275/356

Walecki Piotr , Sarapata Krzysztof , Lasoń Wojciech , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena , Balwierz Walentyna .
Telemedical database of Hodgkin Disease.
W: 2nd International Conference on E-health in Common Europe : Critical conditions for development of e-health environment in transforming economies, Kraków, Poland, March 11-12, 2004 / Ed. by Krzysztof Zieliński, Mariusz Duplaga : abstracts
s. 27.
SZM
AWZ
276/356

Walecki Piotr , Sarapata Krzysztof , Lasoń Wojciech , Pyrczak Wiesław , Roterman-Konieczna Irena , Balwierz Walentyna .
Telemedical database of Hodgkin's disease.
W: Transformation of healthcare with information technologies / ed.
s. 51-7 : bibliogr., abstr.
Studies in Health Technology and Informatics Vol. 105.
RMZ
ORG
RMZ
277/356

Piekarska B[arbara] , Stopa B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J[anina] , Zemanek G[rzegorz] , Spólnik P[aweł] , Roterman I[rena] , Król M[arcin] .
The immunological signal revisited : new evidence emerging from the use of supramolecular protein ligands.
Eur. J. Biochem.
2004 : Vol. 271 suppl. 1, s. 96, abstr. P3.3-21
29th Meeting of the Federation of the European Biochemical Societies, Warsaw, 26 June-1 July 2004.
SZM
SIF
278/356

Śmietański Jacek , Rotterman-Konieczna opiekun Irena .
Automatyczne rozpoznawanie białek zawartych w surowicy krwi.
Prz. Lek.
2003 : T. 60 supl. 2, s. 45, abstr. 182
XLI Ogólnopolska i VII Międzynarodowa Konferencja Studentów Medycyny, Kraków 2003.
SZM
AWZ
Adres url: http://www.wydplek.com.pl
279/356

Nowak M. , Roterman I[rena] , Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] .
BPTI transformed to amyloid form in vitro and in silico.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 186, abstr. 460
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
280/356

Roterman I[rena] , Leluk J. , Konieczny L[eszek] .
Characteristics of repetitive DNA sequences in mouse genome.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, abstr. 383
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
281/356

Piwowar M[onika] , Meus J. , Grzybowski P[iotr] , Wisniowski Z[dzisław] , Roterman I[rena] .
Characteristics of repetitive DNA sequences in the human genome.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 106, abstr. 189
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
282/356

Stopa B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J[anina] , Pawel S. , Piekarska B[arbara] , Roterman I[rena] .
Complexation properties of some Congo red related and nonrelated dyes : structural characteristics of amyloid-specific reagents.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 185, abstr. 457
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
283/356

Król Marcin , Roterman Irena , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Rybarska Joanna , Konieczny Leszek .
Functionally induced structural changes in immunoglobulin G domains registered by liquid crystal ligand binding - a computer simulation.
W: Proceedings of the European Conference on Computational Biology in conjuncton with the French National Conference on Bioinformatics (JOBIM 2003) ECCB'2003 / edited by Catherine Christophe, Hans-Peter Lenhof, Marie-France Sagot, Paris, France, Sept.
s. 225- : PS-33
RZZ
APZ
284/356

Król Marcin , Rotterman-Konieczna promot. Irena .
Komputerowa symulacja związanych z funkcją zmian strukturalnych w domenach immunoglobuliny G rejestrowanych poprzez wiązanie ciekłokrystalicznego liganda : praca doktorska.
Kraków : [Nakł. autora], 2003
122 s. : il.
PDP
ORG
285/356

Jurkowski W[iktor] , Wisniowski Z[dzisław] , Konieczny L[eszek] , Roterman I[rena] .
Limitation of conformational space for early stage of protein folding simulation.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 163, abstr. 382
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
286/356

Król Marcin , Roterman Irena , Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara .
Local and long-range structural effects caused by the removal of the N-terminal polypeptide fragment from immunoglobulin L chain λ.
Biopolymers
2003 : Vol. 69, nr 2, s. 189-200, il., bibliogr. 57 poz., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.733
287/356

Sarapata Krzysztof , Walecki Piotr , Pyrczak Wiesław , Lasoń Wojciech , Roterman Irena , Szybiński Zbigniew .
Medical database of thyroid cancer.
W: International Conference on E-health in Common Europe, Kraków, Poland, June 5-6, 2003 / Ed. by Krzysztof Zieliński, Mariusz Duplaga. - Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET UST, [2003]
s. 347-353 : il., bibliogr. 8 poz.
RZM
ORG
APZ
288/356

Sarapata Krzysztof , Pyrczak Wiesław , Lasoń Wojciech , Walecki Piotr , Roterman-Konieczna Irena , Szybiński Zbigniew .
Medical database of thyroid cancer.
W: International Conference on E-health in Common Europe, Kraków, Poland, June 5-6, 2003 / Ed. by Krzysztof Zieliński, Mariusz Duplaga. - Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET UST, [2003] : abstracts
s. 58 : abstr.
SZM
AWZ
289/356

Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Nowotwory - struktura czy organizacja?
(Cancers - structure or organization?)
Menopauza
2003 : T. 2, z. 3, s. 87-91, il., bibliogr. 32 poz., streszcz., abstr.
AP
PRZ
KBN
Adres url: http://insight.blackhorse.pl
290/356

Zemanek Grzegorz , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Spólnik Paweł , Konieczny Leszek , Roterman Irena , Bugajski Andrzej .
Protein distorsion-derived mechanism of signal discrimination in monocytes revealed using Congo red to stain activated cells.
Folia Histochem. Cytobiol.
2003 : Vol. 41, nr 3, s. 113-124, il., bibliogr. 40 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.475
Adres url: http://www.cm-uj.krakow.pl/FHC
291/356

Piekarska B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J[anina] , Zemanek G[rzegorz] , Krol M. , Nowak M. , Roterman I[rena] .
Role of N-terminal fragment of immunoglobulin light chain Lambda in the stability of the protein (Domain) - Experimental studies on protein-Congo red complexes.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 186, abstr. 458
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
AIF
292/356

Krol M. , Roterman I[rena] , Piekarska B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] .
Role of N-terminal fragment of immunoglobulin light chain Lambda in the stability of the protein (Domain) - theoretical studies on protein-Congo red complexes.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 186, abstr. 459
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
293/356

Leluk Jacek , Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Search for structural similarity in proteins.
Bioinformatics
2003 : Vol. 19, nr 1, s. 117-124, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 6.701
Adres url: http://bioinformatics.oupjournals.org
294/356

Walecki P[iotr] , Pyrczak W[iesław] , Lasoń W[ojciech] , Sarapata K[rzysztof] , Roterman-Konieczna I[rena] , Klekawka T[omasz] , Korab-Chrzanowska E[lżbieta] , Balwierz W[alentyna] .
Skoordynowana baza danych w chorobie Hodgkina (HD) zorientowana na diagnostykę i terapię w systemie rozproszonym.
Prz. Lek.
2003 : T. 60 supl. 5, s. 78, abstr. O-15
II Zjazd Polskiego Towarzystwa Onkologii i Hematologii Dziecięcej, Kraków, 29-30 maj 2003.
SZP
AWZ
Adres url: http://www.wydplek.com.pl
295/356

Zobnina W. , Kieć-Kononowicz K[atarzyna] , Handzlik J[adwiga] , Roterman-Konieczna I[rena] .
Synthesis and conformational analysis of some pyrimido[2,1-f]purinodiones as an attempt at searching for new A2A adenosine receptor antagonists.
W: Polish-Austrian-German-Hungarian-Italian Joint Meeting on Medicinal Chemistry, Kraków, Poland, October 15-18, 2003 : book of abstracts
s. 58 : abstr. P24, bibliogr. 5 poz.
SZZ
AWZ
296/356

Spólnik Paweł , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Konieczny Leszek , Zemanek Grzegorz , Rybarska Janina , Król Marcin , Nowak Mateusz , Roterman Irena .
The structural abnormality of myeloma immunoglobulins tested by Congo red binding.
Med. Sci. Monit.
2003 : Vol. 9, nr 4, s. BR145-BR153, il., bibliogr. 60 poz., summ.
AP
ORG
KBN
Adres url: http://www.medscimonit.com/pub/vol_4/2827.pdf
297/356

Spolnik P[aweł] , Rybarska J[anina] , Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Stopa B[arbara] , Zemanek G[rzegorz] , Krol M. , Nowak M. , Roterman I[rena] .
The structural abnormality of myeloma immunoglobulins tested by Congo red binding.
Protein Sci.
2003 : Vol. 12 suppl. 1, s. 187, abstr. 461
Fifth European Symposium of the Protein Society, Italy, Florence, March 29 - April 2, 2003
SZZ
SIF
298/356

Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Spólnik Paweł , Zemanek Grzegorz , Roterman Irena , Król Marcin .
The structure and protein binding of amyloid-specific dye reagents.
Acta Biochim. Pol.
2003 : Vol. 50, nr 4, s. 1213-1227, il., bibliogr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.629
Adres url: http://www.actabp.pl
299/356

Roterman-Konieczna Irena .
Arkusz kalkulacyjny Excel.
W: Ćwiczenia z informatyki dla studentów medycyny / pod red. Ryszarda Tadeusiewicza.
Kraków : Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, 2002
s. 95-150.
RPO
RMP
300/356

Piwowar Monika , Grzybowski Piotr , Meus Jan , Roterman Irena .
Characteristics of repetitive DNA sequences in human genome.
W: Gliwickie Spotkania Naukowe, Gliwice, Poland, 22-23 November 2002
s. 56.
SZP
AWZ
301/356

Ptak Anna , Rotterman-Konieczna opiekun Irena , Jurkowski opiekun Wiktor .
Charakterystyka strukturalna miejsc wiążących hem w wybranych białkach.
Prz. Lek.
2002 : T. 59 supl. 2, s. 43, abstr. NP-18
XL Ogólnopolska i VI Międzynarodowa Konferencja Studentów Medycyny, Kraków, 12-13 kwietnia 2002.
SZM
AWZ
Adres url: http://www.wydplek.com.pl
302/356

Zemanek Grzegorz , Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Spólnik Paweł , Urbanowicz Barbara , Nowak Mateusz , Król Marcin , Roterman Irena .
Egg yolk platelet proteins from Xenopus laevis are amyloidogenic.
Folia Histochem. Cytobiol.
2002 : Vol. 40, nr 3, s. 311-318, il., bibliogr. 39 poz., abstr.
AP
ORG
AIF
IF: 0.526
Adres url: http://www.cm-uj.krakow.pl/FHC
303/356

Król Marcin , Nowak Mateusz , Roterman Irena , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Konieczny Leszek .
Interaction of immunoglobulin light chain dimer with Congo red - dynamics study.
W: XIV International Biophysics Congress, Buenos-Aires, April 27-May 1, 2002 : book of abstracts.
SZZ
AWZ
304/356

Roterman-Konieczna Irena .
Bioinformatyka we współczesnej biologii.
Alma Mater (Krak.)
2001 : nr 29, s. 10-12, il.
AP
HIS
Adres url: http://www.almamater.uj.edu.pl/
305/356

Rybarska Janina , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Konieczny Leszek , Nowak Mateusz , Król Marcin , Roterman Irena , Szymczakiewicz-Multanowska Agnieszka .
Evidence that supramolecular Congo red is the sole ligation form of this dye for L chain λ derived amyloid proteins.
Folia Histochem. Cytobiol.
2001 : Vol. 39, nr 4, s. 307-314, il., bibliogr. 41 poz., abstr.
AP
AIF
IF: 0.594
Adres url: http://www.cm-uj.krakow.pl/FHC
306/356

Piekarska B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Zemanek G[rzegorz] , Szneler E. , Król M[arcin] , Nowak M. , Roterman I[rena] .
Heat-induced formation of a specific binding site for self-assembled Congo Red in the V domain of immunoglobulin L chain λ.
Biopolymers
2001 : Vol. 59, s. 446-456, il., bibliogr. 61 poz., abstr.
AZ
AIF
IF: 1.845
307/356

Król Marcin , Nowak Mateusz , Roterman Irena , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Rybarska Joanna , Konieczny Leszek .
Interaction of immunoglobulin light chain dimer with Congo red - dynamics study.
W: The Protein Society Fourth European Symposium, Paris, France, 18 - 22 April, 2001 : program and abstracts
s. 95 : abstr. 181.
SZZ
AWZ
308/356

Nowak Mateusz , Król Marcin , Roterman Irena , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Zemanek Grzegorz .
Is the molecular dynamics simulation able to predict the amyloid formation?
W: The 1st Summer School on Parallel Computing in Biomolecular Simulations, Gdansk, Poland, September 1 - September 3, 2001 : program and abstracts
abstr. P-8 : bibliogr. 5 poz.
SZP
AWZ
309/356

Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Jak ograniczać biochemię nauczaną nie ograniczając nauczania?
(How to limit biochemistry without limiting teaching ?)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 258 : abstr. W-13-06.
SZP
AWZ
310/356

Roterman I[rena] , Nowak M. , Król M[arcin] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J. , Stopa B[arbara] , Piekarska B[arbara] , Zemanek G[rzegorz] .
Limitations in molecular dynamics simulations.
W: The 1st Summer School on Parallel Computing in Biomolecular Simulations, Gdansk, Poland, September 1 - September 3, 2001 : program and abstracts
abstr. L-12 : bibliogr. poz.
SZP
AWZ
311/356

Loster Jakub , Jurek Martyna , Roterman opiekun Irena , Król opiekun Marcin .
Możliwości wykorzystania Internetu przez studentów medycyny.
(Internet exploitation by medical students.)
Prz. Lek.
2001 : T. 58 supl. 2, s. 16, abstr. NP-01
39 Ogólnopolska Konferencja Studentów Medycyny, Kraków, 20 - 22 kwietnia 2001.
SZP
AWZ
312/356

Roterman I[rena] .
Podobieństwo strukturalne białek.
(Structural similarity of proteins.)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. a31 : abstr. K-07-01.
SZP
AWZ
313/356

Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Roterman Irena , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz .
Przeciwciała i nośniki leków w terapii celowanej - postęp i ograniczenia.
Biotechnologia
2001 : nr 3, s. 37-52, summ.
AP
KBN
Adres url: http://www.biotechnologia.com.pl/biotechnologia/15
314/356

Kowalczyk Agnieszka , Surma Anna , Rotterman-Konieczna opiekun Irena , Król opiekun Marcin .
Rola dodatkowej grupy fosforanowej w NADP w stosunku do NAD.
(The role of additional P group in NADP versus NAD.)
Prz. Lek.
2001 : T. 58 supl. 2, s. 16, abstr. NP-04
39 Ogólnopolska Konferencja Studentów Medycyny, Kraków, 20 - 22 kwietnia 2001.
SZP
AWZ
315/356

Roterman-Konieczna Irena .
Skąd się biorą nowe leki na początek XXI wieku?
Twój Mag. Med.
2001 : R. 6, nr 1, s. 5-6, il.
AP
PRZ
316/356

Roterman Irena .
Structural similarity search in proteomics.
W: The Protein Society Fourth European Symposium, Paris, France, 18 - 22 April, 2001 : program and abstracts
s. 138 : abstr. 328.
SZZ
AWZ
317/356

Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Piekarska B[arbara] , Zemanek G[rzegorz] , Konieczny L[eszek] , Król M[arcin] , Nowak M. , Roterman I[rena] .
Supramolekularna czerwień Kongo jest ligandem dla białek amyloidowych.
(Supramolecular Congo red is a ligand for amyloid proteins.)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 131-132 : abstr. K-07-03.
SZP
AWZ
318/356

Nowak Mateusz , Król Marcin , Roterman Irena , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Rybarska Joanna , Konieczny Leszek .
The effect of point mutations on amyloidogenicity of monoclonal immunoglobulin light chain. The computational approach.
W: The Protein Society Fourth European Symposium, Paris, France, 18 - 22 April, 2001 : program and abstracts
s. 95 : abstr. 180.
SZZ
AWZ
319/356

Roterman Irena , Król Marcin , Nowak Mateusz , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Zemanek Grzegorz .
Why Congo red binding is specific for amyloid proteins - model studies and a computer analysis approach.
Med. Sci. Monit.
2001 : Vol. 7, nr 4, s. 771-784, il., bibliogr. 36 poz., summ.
AP
KBN
Adres url: http://www.medscimonit.com
320/356

Zemanek G[rzegorz] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Piekarska B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Król M. , Nowak M[ateusz] , Roterman I[rena] .
Wiązanie ligandów supramolekularnych do receptorów komórkowych.
(Supramolecular ligands bound to cell receptors.)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 140 : abstr. P-07-08.
SZP
AWZ
321/356

Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Roterman Irena , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz , Król Marcin , Nowak Mateusz .
Zmiany konformacyjne w cząsteczce immunoglobuliny G wywołane tworzeniem kompleksu z antygenem jako sygnał wyzwalający aktywność efektorową przeciwciała.
(Conformational changes in IgG induced by the complex creation with Congo red as the signal inducing the effector activity in antibody.)
W: XXXVII Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Toruń, 10-14 września 2001
s. 141 : abstr. P-07-10.
SZP
AWZ
322/356

Piekarska Barbara , Konieczny Leszek , Roterman Irena , Król Marcin , Rybarska Janina , Stopa Barbara .
Kompleks łańcucha lekkiego (lambda) immunoglobuliny z supramolekularnym ligandem - czerwienią Kongo.
W: XXXVI Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Poznań 2000 : streszczenia
s. 120-121 : abstr. PO5-57.
SZP
323/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Król Marcin , Nowak Mateusz , Rybarska Janina , Piekarska Barbara , Stopa Barbara , Zemanek Grzegorz .
Monomeryczna i supramolekularna forma czerwieni Kongo w kompleksach z białkami.
W: XXXVI Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Poznań 2000 : streszczenia
s. 136 : abstr. PO5-92.
SZP
324/356

Konieczny Leszek , Roterman Irena .
Strategia działania organizmu żywego.
(The strategy of living organism.)
Kraków : Zamiast Korepetycji, 2000
144 s. : il., bibliogr.
p-ISBN: 83-85434-80-1

MP
ORG
MP
325/356

Skowronek M. , Roterman I[rena] , Konieczny L[eszek] , Stopa B[arbara] , Rybarska J[anina] , Piekarska B[arbara] , Górecki A. , Król M[arcin] .
The conformational characteristics of Congo red, Evans blue and Trypan blue.
Comput. Chem.
2000 : Vol. 24, nr 3-4, s. 429-450, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 0.926
Adres url: http://www.elsevier.com
326/356

Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Piekarska Barbara , Zemanek Grzegorz , Król Marcin , Nowak Mateusz , Roterman Irena .
Układy ciekłokrystaliczne jako potencjalne nośniki leków w technice immunotargetingu.
W: XXXVI Zjazd Polskiego Towarzystwa Biochemicznego, Poznań 2000 : streszczenia
s. 234 : abstr. PO9-44.
SZP
327/356

Skowronek M. , Roterman I[rena] , Konieczny L[eszek] , Stopa B[arbara] , Rybarska J[anina] , Piekarska B[arbara] .
Why do Congo Red, Evans Blue, and Trypan Blue differ in their complexation properties?
J. Comput. Chem.
2000 : Vol. 21, nr 8, s. 656-667, il., bibliogr. 32 poz., abstr.
AZ
ORG
IF: 2.990
328/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Piekarska Barbara , Stopa Barbara .
Congo red bound to β-structural polypeptide chains. (Wiązanie czerwieni Kongo do łańcuchów polipeptydowych o konformacji b).
Protein Sci.
1999 : Vol. 8 suppl. 1, s. 117, abstr. 358-M
Thirteenth Symposium of the Protein Society, Boston, MA, July 24-28, 1999.
SZZ
SIF
329/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Piekarska Barbara , Stopa Barbara .
Congo red bound to β-structural polypeptide chains. (Wiązanie czerwieni Kongo do łańcuchów polipeptydowych o konformacji b).
Protein Sci.
1999 : Vol. 8 suppl. 2
Third European Symposium of the Protein Society, Garmisch-Partenkirchen, 19-22 September, 1999.
AZ
AIF
IF: 4.457
330/356

Roterman I[rena] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Piekarska B[arbara] , Górny M[agdalena] , Król M[arcin] .
Dokowanie ligandu ciekłokrystalicznego czerwieni Kongo do białek - zastosowanie praktyczne.
(Supramolecular Congo red ligand docking to proteins - practical application.)
W: I Krajowy Kongres Biotechnologii, Wrocław, 20-25 września 1999 : referaty
s. 202-203 : il.
SZP
331/356

Skowronek M[arek] , Roterman I[rena] , Konieczny L[eszek] , Stopa B[arbara] , Rybarska J[anina] , Piekarska B[arbara] , Górecki A. , Król M[arcin] .
The structure of Congo Red, Evans Blue and Trypan Blue as seen in calculation using different methods. (Struktura czerwieni Kongo, błękitu Evansa i błękitu Trypanu wyznaczona z wykorzystaniem różnych pól siłowych).
W: 5th International Conference Computers in chemistry '99 and Polish-American Workshop New trends in computational methods for large molecular systems, Szklarska Poręba, Poland, July 1-6, 1999 : program and abstracts
s. P67.
SZP
332/356

Roterman I[rena] , Rybarska J[anina] , Konieczny L[eszek] , Skowronek M[arek] , Stopa B[arbara] , Piekarska B[arbara] , Bakalarski G. .
Congo Red Bound To alfa-1-Proteinase Inhibitor as a Model of Supramolecular Ligand and Protein Complex.
Comput. Chem.
1998 : Vol. 22, nr 1, s. 61-70, il., bibliogr., abstr.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.566
Adres url: http://www.elsevier.com
333/356

Roterman I[rena] , Skowronek M. , Konieczny L[eszek] , Stopa B[arbara] , Rybarska J[anina] , Piekarska B[arbara] , Górny M[agdalena] .
Liquid crystals as supramolecular ligands. (Ciekłe kryształy, jako ligandy supramolekularne).
W: Annual Conference of the HP2EUG.
SZZ
334/356

Skowronek M. , Stopa B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Rybarska J[anina] , Piekarska B[arbara] , Szneler E. , Bakalarski G. , Roterman I[rena] .
Self-Assembly of Congo Rad - A Theorethical and Experimental Appropach to Identify Its Supramolecular Organization in Water and Salt Solution.
Biopolymers
1998 : Vol.46, s. 267-281.
AZ
AIF
IF: 2.086
335/356

Stopa B[arbara] , Górny M[agdalena] , Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Rybarska J[anina] , Skowronek M[arek] , Roterman I[rena] .
Supramolecular ligands : Monomer structure and protein ligation capability.
Biochimie
1998 : Vol. 80, nr 12, s. 963-968, il., bibliogr. 29 poz., abstr.
AZ
AIF
IF: 1.617
Adres url: http://www.elsevier.com
336/356

Roterman Irena , Skowronek Marek , Konieczny Leszek , Rybarska Janina , Stopa Barbara , Piekarska Barbara .
Computer aided drug design.
W: HiPer '97 - High Performance Computing on Hewlett-Packard Systems, Kraków, Poland, November 5-8, 1997 : conference proceedings / ed. Marian Bubak, Jacek Mościński. - Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET-KRAKÓW, [1997]
s. 195-201 : abstr.
RZP
ORG
RMP
337/356

Stopa B[arbara] , Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Roterman I[rena] , Rybarska J[anina] , Skowronek M[arek] .
Effect of self association of bis-ANS and bis-azo dyes on protein binding.
Biochimie
1997 : Vol. 79, nr 1, s. 23-26.
AZ
AIF
IF: 1.441
338/356

Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Rybarska Janina , Skowronek Marek , Stopa Barbara , Tabor Barbara , Dąbroś Wojciech , Pawlicki Roman , Roterman Irena .
The use of Congo Red as a lyotropic liquid crystal to carry stains in a model immunotargeting system - microscopic studies.
Folia Histochem. Cytobiol.
1997 : Vol. 35, nr 4, s. 203-210, il., bibliogr. 21 poz., abstr.
AP
ORG
339/356

Piekarska B[arbara] , Skowronek M. , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Roterman I[rena] , Konieczny L[eszek] .
Congo red-stabilized intermediates in the λ light chain transition from native to molten state.
Biochimie
1996 : Vol. 78, s.183-189, il., bibliogr. 37 poz., sum.
AZ
ORG
AIF
IF: 2.160
340/356

Konieczny Leszek , Piekarska Barbara , Roterman Irena , Rybarska Janina , Skowronek Marek , Stopa Barbara .
Perspektywy wykorzystania supramolekularnych struktur ciekłokrystalicznych do stabilizacji funkcyjnej konformacji białek.
(Perspectives in using liquid crystals to stabilize functional conformation of proteins.)
Wiad. Chem.
1996 : T. 50, nr 1-2, s. 29-42, il., bibliogr. 51 poz., abstr.
5 Sympozjum Polskiego Towarzystwa Chemicznego pt. Konformacja peptydów i struktura białek, Karpacz 29.04.-02.05. 1995.
RZP
PRZ
341/356

Roterman Irena .
Modelling the optimal simulation path in the peptide chain folding - Studies based on geometry of alanine heptapeptide.
J. Theor. Biol.
1995 : Vol. 177, nr 3, s. 283-288, il., bibliogr. 9 poz.
AZ
ORG
AIF
IF: 1.110
342/356

Rybarska J[anina] , Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Stopa B[arbara] , Roterman I[rena] .
The detection of specific acute phase serum protein complexes and immune complexes by Congo Red binding.
J. Physiol. Pharmacol.
1995 : Vol. 46, nr 2, s. 221-231, il., bibliogr. 20 poz.
AP
ORG
343/356

Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Rybarska J[anina] , Stopa B[arbara] , Krzykwa B[ogusława] , Noworolski J[an ] , Pawlicki R[oman] , Roterman I[rena] .
Bis azo dye liquid crystalline micelles as possible drug carriers in immunotargeting technique.
J. Physiol. Pharmacol.
1994 : Vol. 45, nr 3, s. 441-454, il., bibliogr. 22 poz.
AP
ORG
344/356

Roterman Irena , Konieczny Leszek , Stopa Barbara , Rybarska Janina , Piekarska Barbara .
Heat-induced structural changes in the Fab fragment of IgG recognized by molecular dynamics simulation - implications for signal transduction in antibodies.
Folia Biol. (Krak.)
1994 : Vol. 42, nr 3-4, s. 115-128, il., bibliogr.
AP
ORG
IF: 0.125
345/356

Piekarska B[arbara] , Roterman I[rena] , Rybarska J[anina] , Konieczny L[eszek] , Kaszuba J. .
The melting of native domain structure in effector activation of IgG studied by using Congo Red as a specific probe.
J. Physiol. Pharmacol.
1994 : Vol. 45, nr 1, s. 147-162, il., bibliogr. 27 poz.
AP
ORG
346/356

Roterman I[rena] , No K. T. , Piekarska B[arbara] , Kaszuba J. , Pawlicki R[oman] , Rybarska J[anina] , Konieczny L[eszek] .
Bis azo dyes - studies on the mechanism of complex formation with IgG modulated by heating or antigen binding.
J. Physiol. Pharmacol.
1993 : Vol. 44, nr 3, s. 213-232, il., bibliogr. 21 poz.
AP
ORG
347/356

Kaszuba J. , Konieczny L[eszek] , Piekarska B[arbara] , Roterman I[rena] , Rybarska J[anina] .
Bis-azo dyes interference with effector activation of antibodies.
J. Physiol. Pharmacol.
1993 : Vol. 44, nr 3, s. 233-242, il., bibliogr. 14 poz.
AP
ORG
348/356

Roterman Irena .
Możliwości i znaczenie techniki komputerowej w symulacji zjawisk i modelowaniu struktur biologicznych.
(The possibilities and the importance of computers in the simulation and modulation of biological structures.)
Prz. Lek.
1993 : T. 50, nr 7-8, s. 229-232, bibliogr. 15 poz.
p-ISSN: 0033-2240

AP
PRZ
349/356

Roterman Irena , Kopydłowski Jerzy .
Budowa i zasady funkcjonowania komputerów.
W: Informatyka medyczna : skrypt.
pod red. Jana Trąbki.
Kraków : [AM], 1992.
s. 16-26 : il.
RPO
ORG
RMP
350/356

Roterman Irena , Stanuch Helena .
Komputery w naukach medycznych. Modelowanie układów biologicznych.
W: Informatyka medyczna : skrypt.
pod red. Jana Trąbki.
Kraków : [AM], 1992.
s. 103-110 : il., bibliogr.
RPO
ORG
RMP
351/356

Roterman Irena , Stanuch Helena .
Przykłady zastosowania modelowania w wybranych zagadnieniach biologicznych.
W: Informatyka medyczna : skrypt.
pod red. Jana Trąbki.
Kraków : [AM], 1992.
s. 168-170.
RPO
ORG
RMP
352/356

Rybarska Janina , Konieczny Leszek , Roterman Irena , Piekarska Barbara .
The effect of azo dyes on the formation of immune complexes.
Arch. Immunol. Ther. Exp.
1991 : Vol. 39, nr 3, s. 317-327, il., bibliogr. 15 poz.
AP
ORG
353/356

Krupiński Jerzy , Krupińska Aleksandra , Lejman Lidia , Modelska Danuta , Roterman Irena , Ściegienny-Malec Jolanta , Rutkowska Halina .
Obraz kliniczny próchnicy wtórnej w zależności od klasy ubytku i rodzaju materiału wypełniającego.
(Clinical pattern of secondary dental caries in relation to tissue deffect class and type of filling material.)
Czas. Stomatol.
1990 : T. 43, nr 10, s. 595-599, bibliogr. 9 poz., sum.
AP
ORG
354/356

Stanisz Andrzej , Trąbka Wojciech , Trąbka Jan , Kopydłowski Jerzy , Meus Jan , Roterman Irena .
Wyniki zastosowania informatycznego systemu profilaktyki zdrowotnej w badaniu dużych populacji. Część II.
Zdr. Publ.
1988 : T. 99, nr 6, s. 273-280, il., bibliogr., sum.
p-ISSN: 0044-2011

AP
ORG
355/356

Stanisz Andrzej , Trąbka Wojciech , Trąbka Jan , Kopydłowski Jerzy , Meus Jan , Roterman Irena .
Wyniki zastosowania informatycznego systemu profilaktyki zdrowotnej w badaniu dużych populacji. Część I.
Zdr. Publ.
1988 : T. 99, nr 5, s. 237-244, il., bibliogr., sum.
p-ISSN: 0044-2011

AP
ORG
356/356

Trąbka Wojciech , Gurba K. , Roterman Irena .
Systemy informatyczne w medycynie.
W: Propedeutyka Informatyki Medycznej.
Red. Jan Trąbka.
Kraków : Akademia Medyczna, 1982.
s. 127-152.
SKR